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学习小组Day3笔记-安装软件(李其龙)

学习小组Day3笔记-安装软件(李其龙)

作者: 李其龙_ec81 | 来源:发表于2018-09-12 16:40 被阅读6次

    linux系统下安装软件

    摘要: 本文将从以下四个方面介绍在linux系统下安装如何安装软件,包括软件安装前的准备工作、使用命令行下载软件、安装及配置软件环境、fastqc示例安装。

    软件安装前的准备工作

    在开始本文之前,我发现实验楼好棒啊!

    检查服务器内是否有bzip2

    bzip2是一款在linux在打包、压缩的软件。


    不存在bizp2
    安装完成

    如果使用yum install xxxx,会找到安装包之后,询问你Is this OK[y/d/N],需要你手动进行选择。但是如果加上参数-y,就会自动选择y,不需要你再手动选择!

    1. yum -y install 包名(支持*) :自动选择y,全自动
    2. yum install 包名(支持*) :手动选择y or n
    3. yum remove 包名(不支持*)
    4. rpm -ivh 包名(支持*):安装rpm包
    5. rpm -e 包名(不支持*):卸载rpm包

    conda是什么

    conda类似于npm或maven的包管理工具,只是conda是针对于python的。可以安装minconda或anaconda进行安装,前者是简化版本,只包含conda和其依赖。如果安装环境有python相关包也没有关系,不需要进行卸载。引用自https://blog.csdn.net/koflance/article/details/78582737

    Conda is an open source package management system and environment management system that runs on Windows, macOS and Linux. Conda quickly installs, runs and updates packages and their dependencies. Conda easily creates, saves, loads and switches between environments on your local computer. It was created for Python programs, but it can package and distribute software for any language.quoted from
    https://conda.io/docs/

    推荐阅读:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4NjU4ODQ2MQ==&mid=2247483691&idx=1&sn=ac34d79497d094764d5d58726d00f07f&chksm=fdf84969ca8fc07f28604ccda852eb6ef92a49eabf2787c5d0e02437fdd75e6bab186ad87c15&scene=21#wechat_redirect

    使用命令行下载软件

    下载中
    1. sh是一个脚本
    2. 使用wget命令
    3. 左键复制右键粘贴
      完成
      选择了Python 3.7版本 没找到文中的3.6版本

    使用bash运行刚刚下载sh脚本

    运行完成
    记得使用Tab键补全哦
    安装完成
    出现了!神龙

    安装fastqc

    自动安装
    完成

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