原文发表于2006年12月，后有改动。
总计40小时左右，断断续续地把这个游戏打完了，抑或是把动画看完了。和之前的习惯大相径庭，远远及不上多年前首次玩孪蛇和自由之子那时的狂热。
而且，自己的感觉迟钝到剧情进行了一半的时候，才突然意识到主角Snake并不是前作《合金装备·孪蛇》的主人公，而是《孪蛇》主人公生理而并非伦理上的父亲——之所以说是生理上，是因为《孪蛇》的主人公Solid仅是本作主人公的基因克隆。这种以前传形式出现的续作，实在是太多了：星球大战、无间道……所以在刚开始明白这个情况的时候，多多少少有些审美疲劳。但再接着玩下去，才逐渐领略到小岛超强的剧情掌控（导演）能力。
毋宁说Snake是本作的主人公，不如说作品更成功地塑造了The BOSS这个形象，Snake的恩师。这个人的出现，打破了主角一定需要由德才貌兼备、文武双全的年轻男女担纲的宿命。一个将近四十岁的女人，历经腥风血雨，立下无数功勋，早已看透战争只是政治概念的外延产物，却依然义无反顾地投入，带给我的已经不是震撼，而是震颤的感觉。
The BOSS和Snake发生对立，最终进行决斗的原因随着情节的进展被一点点挖掘出来。The BOSS本身作为秘密部队的尖刀，几乎已经成功完成了使命，谁知变生不测，一个突如其来的核弹引爆事件使她不得不成为了政治斗争和交易的牺牲品——作为事件的见证，她必须被掩盖、被抹杀，更致命的是，她必须伪装成一个彻头彻尾的“叛国者”而被自己一手调教出来的得意弟子Snake所抹杀——这是她所接受指令的最后一环。
The BOSS忠实执行了所有的任务，尤其是最后这条指令。在Snake惊讶于她的改变时，她却用出格的冷漠掩盖了内心几乎超出想象的痛苦——她被明令严禁向Snake说出这个指令。直到Snake最后扣下扳机时，她才终于得以解脱。
The BOSS死在了花丛中，死在了自己一手养大的、对自己只有崇拜爱戴而无他想的Snake手中。除了极少数人以外，她的死是不名誉的、是罪有应得的，这是她留给世人的“官方”记录。当然，她对这些记录没有感觉，曾经在乎过的，只是希望Snake能够了解，她是作为一个女人死去的，而不是一个战士……
最终，Snake还是通过间接的途径，得知了The BOSS和他反目的原因。在The BOSS的坟前，他端正地行了一个军礼，其间脸上的复杂表情无法用语言来描述（是在慨叹The BOSS命运的不幸，还是在想自己以后有一天会步上The BOSS的后尘？）。
天空中没有两个太阳，地面上只有一位国王。
——田中芳树·《亚尔斯兰战记》·《帕尔斯诗抄》
世事终有轮回，在Snake被授予勋章而成为新一代“The Big BOSS”的时候，他的心里在想什么？自己被作为政治交易的牺牲品而被推上祭坛的日子，究竟在什么时候？
Snake恐怕更想不到的是，在授勋仪式上高层们意味深长的简单两句话，就勾勒出了以他为中心、建造“魔童计划”的计划雏形。他更想不到的是，在几十年后，自己的肉体会成为各方争夺的焦点，而引发更多的流血、阴谋、暴乱。
这是结束的开始，还是开始的结束……
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