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【现学现卖】SARS-CoV-2还是COVID-19——它到底叫

【现学现卖】SARS-CoV-2还是COVID-19——它到底叫

作者: 番茄随笔 | 来源:发表于2020-06-23 01:56 被阅读0次

    原文链接(里面有一些排版和表格没有能很好复制过来)

    https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MzU2Mjc1OA==&mid=2247484726&idx=1&sn=75c98f83b50f6af64fb1329570e1ff8d&chksm=eb89835fdcfe0a497012ad4f77adc4c6c33ccebd9f072cdb2ae7594ce2404d5d16bd25168c03&scene=21&token=605650308&lang=zh_CN#wechat_redirect

    1 分类名称

    每次看英文文献,都很难把分类名称的英文和中文联系起来:

    域-domain

    界-kingdom

    门-division/phylum

    纲-class

    目-order

    科-family

    属-genus

    种-species

    我一直很好奇为什么会这么翻译呢?后来查一些资料,发现很可能是从日语中生物分类的汉字借鉴过来的(那个年代,很多专业名词都是)。

    常见生物名称和分类

    没有写出亚门,亚纲,亚目,亚科

    中文英文拉丁文(单/复数)人豌豆酿酒酵母

    域domainregio, regiones真核域;Eukarya真核域;Eukarya真核域;Eukarya

    界kingdomregnum, regna动物界;Animalia植物界;Plantae真菌界;Fungi

    门division(植物)divisio, divisiones脊索动物门被子植物门子囊菌门

    phylum(动物)phylum, phylaChordataMagnoliophytaAscomycota

    纲classclassis, classes哺乳纲;Mammalia双子叶植物纲;Dicotyledoneae酵母纲;Saccharomycetes

    目orderordo, ordines灵长目;Primates豆目;Fabales酵母目;Saccharomycetales

    科familyfamilia, familiae人科;Hominidae豆科;Fabaceae酵母科;Saccharomycetaceae

    属genusgenus, genera人属;Homo豌豆属;Pisum酵母属;Saccharomyces

    种speciesspecies, species智人;H. sapiens豌豆;P. sativum酿酒酵母;S. cerevisiae

    2 学名后缀

    文献有时候会提到分类名词,说哪个family的病毒,但是多数的时候直接写的是这个病毒的科的名称,这个时候就需要看学名的后缀,来判断他说的是什么。

    属以上学名后缀

    分类单元植物藻类菌类动物细菌/古细菌

    门Division/Phylum-phyta-phyta-mycota

    亚门Subdivision/Subphylum-phytina-phytina-mycotina

    纲Class-opsida-phyceae-mycetes

    亚纲Subclass-idae-phycidae-mycetidae

    目Order-ales-ales-ales-ales

    亚目Suborder-ineae-ineae-ineae-ineae

    总科Superfamily-acea-acea-acea-oidea

    科Family-aceae-aceae-aceae-idae-aceae

    3 病毒的分类,命名

    一、分类

    病毒的分类和命名参考国际病毒分类委员会(ICTV)公布的最新版本的报告,现在最新版是2019年修订的(在今年春天发布,好像是第九个版本啦)。

    https://talk.ictvonline.org/

    随着测序技术的发展,越来越多的病毒被发现和鉴定,让曾经简单且不统一的病毒分类和命名变得规范起来,建立起了15级分类层次结构。

    二、命名

    病毒的“种”是指构成一个复制谱系,占据一个特定小生境,具有多个分类特征的病毒。“种”的确定由多原则分类特征决定,包括病毒的基因组成,病毒颗粒形态结构,生理生化特征,血清学特征等。

    “种”的命名由几个具有实际意义的词组成,一般是宿主名+症状名+“virus”和一些数字构成。

    “属”是一群具有某学共同同特征的“种”,其词尾为“-virus”,但是再设立新的病毒属时,必须由一个同时被承认的代表种(type species)。接下来科名词尾为“-viridae”;亚科名的词尾为“-virinae”;目名的词尾为“-virales”。

    今年的新冠病毒的命名也是遵循统一的病毒命名原则,图中SARS-CoV-2是ICTV对于病毒的命名,而COVID-19则是WHO对这次疾病命名的简称。

    三、书写

    书写规则参照:

    https://talk.ictvonline.org/information/w/faq/386/how-to-write-virus-and-species-names

    首先是较大的分级:目,科,属都需要斜体和首字母大写。

    种名斜体,首字母大写,种名由多个单词组成,如果其中组成单词是专有名词或者字母,那么它们需要大写,否则小写。且种名不缩写。

    比如:

    Sandfly fever Naples phlebovirus

    Salmonella virus SP6

    病毒的名字不斜体,哪怕其中包含了寄主的种属名也是不需要斜体;如果病毒名字的第一个单词是专有名词,则大写;单独出现的字母需大写;病毒名字较为常用,往往有缩写形式。

    比如:

    dengue virus 2;

    West Nile virus;

    Salmonella phage SE1;

    Sida ciliaris golden mosaic virus (SCGMV);

    Aphids transmit potato virus Y (PVY)。

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