富集分析结果展示（二）——富集分析圈图

“做cox比例分析和KM曲线结合分析，阈值该怎么选取，数据是否需要标准化等等问题的解决方法”

01—研究背景

对基因功能富集结果的展示有很多种展示方法，有人说气泡图展示富集结果不好看，毕竟什么都要看颜值的。而且气泡图展示的信息有限，仅展示一些通路的基本信息，无法显示通路与基因的关系。为了满足审美观，开发了一个小工具——富集分析圈图。绘制出来的图不但能显示感兴趣的基因与通路的关系，关键绘制出来的图形颜值高。

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http://sangerbox.com/Tool 点击“富集分析圈图快速绘制工具”

02—使用方法

1.输入数据

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富集分析结果：一共四列，第一列为富集分析term名称，第一列为这个term包含的基因个数，第三列为P值或FDR，第四列为term中包含的基因列表，基因与基因之间一“/”隔开，如下图所示。

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差异基因分析结果：这里去Foldchage最大的前50个基因，取出的基因与做富集时用的基因要一致。注意：这里不一定需要Fold chage，只需要一列是基因，一列对应的有意义的数字即可，如下图所示。

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2.设置参数

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3.展示结果

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