首先用tophat，hisat等比对软件生成BAM文件
然后用deeptoos转化
deeptools Installation
conda install -c bioconda deeptools
bamCoverage 转化为bw文件
samtools index -@ 24 accepted_hits.bam
bamCoverage -b accepted_hits.bam -o SRR2064456.bw -p 24
首先用tophat，hisat等比对软件生成BAM文件
然后用deeptoos转化
conda install -c bioconda deeptools
samtools index -@ 24 accepted_hits.bam
bamCoverage -b accepted_hits.bam -o SRR2064456.bw -p 24
本文标题：bam2bw,上传ucsc可视化
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/udjsbftx.html
网友评论