flash软件合并双端reads

网页：

http://ccb.jhu.edu/software/FLASH/

merge的示意图

用处：

有时候测得双端但是后续分析只用单端的时候，可以merge上R2端

下载安装：

wget FLASH-1.2.11-Linux-x86_64.tar.gz

tar zxvf FLASH-1.2.11-Linux-x86_64.tar.gz

cd FLASH-1.2.11-Linux-x86_64

pwd

直接运行：../flash --help

try：

.../flash ChAR-seq1_R1.fq ChAR-seq1_R2.fq -z

-z 为压缩