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【R语言】随机森林代码

【R语言】随机森林代码

作者: 生信交流平台 | 来源:发表于2023-06-06 16:54 被阅读0次

随着chatGPT的火爆,AI也受到了大家的广泛关注。机器学习(Machine learning)作为AI的一种,在生物医学领域也有着广泛的应用。今天小编就跟大家分享一个很流行的机器学习方法,随机森林(Random Forest)。下面以iris这套数据的分类问题为例,为大家演示机器学习的大体过程。

# 载入数据集 (以 iris 数据集为例)
data(iris)

# 使用 caret 包进行模型训练和评估
library(caret)

# 划分数据集为训练集和测试集
set.seed(111)
train_indices <- createDataPartition(iris$Species, p=0.7, list=FALSE)
train_data <- iris[train_indices,]
test_data <- iris[-train_indices,]

# 生成参数组合的网格矩阵
param_grid <- expand.grid(mtry = seq(1, 10, by=1))

# 建立模型
rf_model <- train(Species ~ ., 
                  data = train_data, 
                  method = "rf",
                  trControl = trainControl(method = "cv", number = 10),
                  tuneGrid = param_grid
                  )

# 打印最佳调参结果
print(rf_model$bestTune)

# 对测试集进行预测并输出分类准确率
predictions <- predict(rf_model, test_data)
confusionMatrix(predictions, test_data$Species)$overall["Accuracy"]

可以得到在测试集上的预测准确度为

 Accuracy 
0.9555556

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