MAFFT：multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

Windows-Ubuntu
1.下载：

wget https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/mafft_7.427-1_amd64.deb

2.安装

sudo dpkg -i mafft_7.427-1_amd64.deb
which mafft
/usr/bin/mafft

默认安装位置，如果安装在win盘符下会提示无效

3.使用（command line
进入存放需要比对文本的文件夹

$ mafft input.txt > output.txt

TIM图片20190429161206.png

好了，这样就已经开始工作了