用cytoscape画ppi的时候总是网络过大，边太多，做出来的图就乱七八糟、黑乎乎的，像下面这样：
ppi网络解决办法就是隐藏一部分边就可以美观很多啦。
首先，得做一个边文件，选出你想要保存的重要的边。我是用R做的，边的格式像下面这样：
边文件
第一列是genea (interacts with) geneb，注意有空格，第二列是边的分组。把想要的边放入一组。
导入table，选导入边，之后就变成这样了
导入table
边的属性多了一组
然后！重点来了，把不需要的边透明度调成0，需要的边调成255（或者随意）：
列选择你定义的组
边一下子就少了不少啦
看起来好多了
最后改一改边、点颜色大小粗细形状巴拉巴拉，一个图就看来干净不少啦
就杰样吧
用cytoscape画ppi的时候总是网络过大，边太多，做出来的图就乱七八糟、黑乎乎的，像下面这样： 解决办法就是...
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本文标题：cytoscape隐藏一部分边
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