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零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CC

零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CC

作者: 生信交流平台 | 来源:发表于2022-01-15 20:55 被阅读0次

    小编前面给大家详细介绍了

    GO和KEGG富集分析视频讲解

    ☞GO简介及GO富集结果解读

    ☞四种GO富集柱形图、气泡图解读

    ☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图,气泡图

    ☞KEGG富集分析—柱形图,气泡图,通路图

    当然主要用到的是R语言来做富集分析和可视化。有小伙伴反映没有R基础,能不能做出发表级的GO和KEGG富集分析图。

    没有R基础可以学习嘛

    ☞R语言入门-工欲善其事必先利其器

    ☞R语言书单:从入门到进阶都在这!

    当然不愿意学,也是可以做出发表级图片的。小编前面也用了好几期的内容来给大家分享如何零代码做GO和KEGG富集分析,主要用到的是DAVID这个网页工具,并且零代码展示GO和KEGG富集分析的结果,主要用到的是Excel。

    1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换
    2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析
    3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果
    4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示

    5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG

    你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。

    下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。

    上面这张figure分了四张柱形图来分别展示BP,CC,MF和KEGG,这种方法小编在下面这个视频中已经详细介绍过了

    ☞零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG

    可能有小伙伴会说,有些文章里面用到的是下面这种展示方法,BP,CC和MF在同一张图里面展示,分别用不同的颜色来区分。其实如果仔细看过小编前几期视频内容的小伙伴,应该能自己做出这张图来。如果搞不定的,可以参考文末视频。

    零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CC

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