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如何利用GEO,TCGA数据库研究新型冠状病毒受体ACE2的表达

如何利用GEO,TCGA数据库研究新型冠状病毒受体ACE2的表达

作者: 小鸡快跑2008 | 来源:发表于2020-03-09 16:32 被阅读0次

    随着新型冠状病毒疾病(COVID-19)疫情发展逐渐得到有效控制,科学家对病毒的研究也有了很大进展。

    据报道新型冠状病毒就是通过Spike蛋白与人ACE2蛋白的结合进入细胞内部,所以ACE2蛋白或将成为研究新型冠状病毒的突破口。

    那问题来了,ACE2蛋白主要在哪些细胞表达?ACE2蛋白的表达与哪些因素有关?

    浙江大学吴超发表的《Single-cell RNA expression profiling of ACE2, the putative receptor of Wuhan 2019-nCoV, in the nasal tissue》基于公开的GEO数据库单细胞RNA-Seq数据集GSE122960,分析了呼吸道不同位置组织中的ACE2 RNA表达谱。结果表明ACE2表达出现在鼻上皮细胞中。

    图1

    南加大公卫学院环境健康科学部的Guoshuai Cai撰写的《Tobacco-use disparity in gene expression of ACE2, the receptor of 2019-nCov》利用GEO,TCGA数据库挖掘的方法找到了ACE2的表达相关因素

    更多GEO数据库挖掘方法关注文章《GEO数据库挖掘出科研基金项目》https://www.jianshu.com/p/23543cb66a4f

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