转载自-诺禾致源-知乎 从提出人类基因组计划发展至今，已经超过了20年。目前，一个物种参考基因组的构建，往往是选取...[作者空间]
启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需...[作者空间]
现在已经找出了转录因子的结合位点，那么这些位点所调控的基因具有什么功能，就得需要进行功能富集分析。有两种方法 方法...[作者空间]
Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)是用于评估...[作者空间]
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基...[作者空间]
我们在做数据挖掘的时候，有时候遇到的数据，提供的基因名是ensemble号，人的话是ENSG开头，比如ENSG00...[作者空间]
【202301】Q:write a genome assembly and annotation pipeline...[作者空间]
今天开启重测序分析专题啦！恳请各位观众老爷点点关注！ 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软...[作者空间]
Bio.tools bio.tools · Bioinformatics Tools and Services D...[作者空间]
参考文献High-resolution spatiotemporal transcriptome mapping ...[作者空间]
How to get phylogenetic tree from kraken or bracken outpu...[作者空间]
转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合 (T...[作者空间]
欢迎关注Bioinfor 生信云！ 上一篇推文讲了bulk RNA-Seq 的数据清洗部分，接下来就是将清洗后的数...[作者空间]
你一定遇到过这种情况，在一个有几百万文件的目录中执行ls命令，ls就卡在那了，是吧？但是，用ls -l -f命令可...[作者空间]
思考题1：什么是生物信息学，如何理解其含义？为什么在大规模测序研究中，生物信息学至关重要？ 一、生物信息学有三个方...[作者空间]
1. 如果在没有jdk12的conda下安装snpeff，会报错 解决方法（针对非root用户） 参考：https...[作者空间]
写在前面 前述，咱们已经完成了： 重测序读段回帖到基因组上，得到了 SAM 文件 对 SAM 文件进行排序，得到 ...[作者空间]
前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因...[作者空间]
singularity 容器技术是一种以应用软件为中心的虚拟化技术。以应用软件为单元，将软件及所有的依赖打包成容器...[作者空间]
基因组的序列提取，详情请看我之前的教程：https://www.jianshu.com/p/211a262aebc...[作者空间]
