随着纯生信的发展,几年前的套路已经很难发表文章了,就像下面的这种套路文章:
The Cancer Genome Atlas (TCGA) based m6A methylation-related genes predict prognosis in hepatocellular carcinoma
分析内容操作步骤:
1、下载TCGA数据,提取出15个m6A基因基因矩阵,做差异分析,并且绘制热图
2、做相关性分析
3、对差异的m6A基因做生存分析
4、进行肿瘤分型,根据一致性聚类与主成分分析的分型结果进行生存分析
5、对15个m6A做单因素Cox回归,然后选出有意义的进行lasso回归进行进一步筛选,然后选到5个基因构建多因素Cox回归,计算risk score,根据高低risk score 绘制生存曲线和ROC曲线
5、将5基因模型的risk score联合临床进行单因素和多因素的Cox回归,并且绘制相关的热图
像上面这种文章在PubMed上可以检索到一大堆,说明m6A这个热点早已经烂大街了,现在很多期刊对这样的文章都是比较反感的,因为觉得没有什么创新,因为别人把能做的都做了。如果你将基因替换一下,情况就不一样了,你可以替换成其他甲基化修饰,例如m7G,这个热点的纯生信都是空白的,就等着大家去抢发这个热点。
现在都是很卷的,大家都懂得了创新,就看谁的热点最新、谁的速度快,谁就能占得抢先发表的机会。现在连很多低分的期刊都需要看你的纯生信文章是否创新,一看是比较旧的稿子,立刻秒拒,有不少做纯生信的人都有这样的体会。
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