水稻催芽的方法很多，如蒸气催芽、催芽机催芽、火炕催芽、限水催芽、大堆催芽、塑料棚催芽等等。蒸气催芽需要设备和燃料、技术较难，不宜普及。催芽机催芽需专用设备和动力，但可适用机播机插的单位和种地大户。火炕催芽适合用种最少的农家使用，但应加强管理，如不及时管理，上下层种子受热不均匀，发芽长短不齐。限水催芽方法简单，但需要经常浇温水，因为不翻种，发芽不整齐。大堆催芽多在联产承包以前集体生产时应用，靠人工加温，保温措施较简单，种温提高得慢，发芽时间长，发芽长短不齐。塑料棚催芽，把大堆催芽与塑料大棚催芽相结合，靠自然加温，种子受热均匀，发芽整齐，而且适合广大农村推广使用。不管用哪一种方法催芽，注意水源，防止水质恶化都对种子催芽很重要，在水中加入0.3-0.5%的益富源芽苗生态宝，可以补充水中益生菌，预防烂根烂芽，促进芽体发育，提高发芽率。
根据种子发芽对温度的要求，催好芽的关键是掌握高温破胸、适温催芽和低温晾芽。
1.高温破胸就是吸足水分的种子用35～40℃的温水浸种3～5分钟，温室内保持32℃，使种子在高温(32℃)下破胸，种子在较高温度下发芽快而整齐。
2.适温催芽就是种子破胸后，稻谷的呼吸作用迅速增强，产生大量的热能，温度就会迅速上升。此时要进行翻堆，淋水降温，种堆摊薄，使种子温度保持在25～30℃适温下发芽。
3.温炼芽就是当芽达到标准时，就可在室温下炼芽，增强适应秧田环境的能力，如果热种下田，幼芽受到骤冷刺激，容易产生死芽。炼芽时间以种谷已降温与室温一致为好。一般第一天上堆，第二天破胸，第三天上午炼芽，下午可播种。
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