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【machine learning】- 决策树(DTs)之Pyt

【machine learning】- 决策树(DTs)之Pyt

作者: Jason_Yuan | 来源:发表于2015-05-31 10:00 被阅读3664次

    这学期AI课的最后一次assignment,老师要让大家实践一下decision tree,而且“You can use any existing machine learning tool for this task”,所以就有了我下面这篇文章,不足之处,望指正,共勉!


    目录###

    1. 环境搭建
    2. 什么是Decision Tree?
    3. 具体Python实现,附代码


    1. 环境搭建

    1.1 用Python实现机器学习的基础环境搭建, click here.

    1.2 安装 pyparsing (1.5.7) 和 pydot

    注:以下针对于 Mac OS 并且使用 Python2.7

    • 如果已经安装了pyparsing (2.x.x),操作如下:
        $ pip uninstalled pyparsing
        $ pip install -Iv https://pypi.python.org/packages/source/p/pyparsing/pyparsing-1.5.7.tar.gz#md5=9be0fcdcc595199c646ab317c1d9a709
        $ pip install pydot
    
    • 如果没有安装过pyparsing任何版本,操作如下:
        $ pip install -Iv https://pypi.python.org/packages/source/p/pyparsing/pyparsing-1.5.7.tar.gz#md5=9be0fcdcc595199c646ab317c1d9a709
        $ pip install pydot
    

    1.3 安装 GraphViz

    graphviz

    Graphviz (Graph Visualization Software) 是一个由AT&T实验室启动的开源工具包,用于绘制DOT语言脚本描述的图形。

    • GraphViz不能通过pip安装。 所以,下载对于Mac的正确版本(graphviz-2.36.0.pkg)之后,自行安装。
    • 你可能还需要安装xlrd
        $ pip install xlrd
    

    2. 什么是Decision Tree?

    决策树(Decision Tree)是基于符号的监督学习方法中的一种。更多相关知识,可以看我另外一篇文章


    3. 具体Python实现

    • 导入library
    import numpy as np
    import pandas as pd
    from sklearn import tree
    from sklearn.feature_extraction import DictVectorizer
    
    • 读取数据
    • 使用pandas读取Excel文件,当然pandas还支持多种文件格式的读写,比如:text, sql, json, csv ......
    • 使用pd.read_excel() 读取后默认生成 pandas.DataFrame
    # read data from excel file as DataFrame
    raw_train_data = pd.read_excel("/Users/boyuan/Desktop/TrainingData.xlsx", parse_cols=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11])
    raw_test_data = pd.read_excel("/Users/boyuan/Desktop/TestingData.xlsx", parse_cols=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11])
    
    • 清洗数据
     # If the data has missing values, they will become NaNs in the resulting Numpy arrays.
     # The vectorizer will create additional column <feature>=NA for each feature with NAs
    
     raw_train_data = raw_train_data.fillna("NA")
     raw_test_data = raw_test_data.fillna("NA")
    
     exc_cols = [u'adjGross']
     cols = [c for c in raw_train_data.columns if c not in exc_cols]
    
     X_train = raw_train_data.ix[:,cols]
     y_train = raw_train_data['adjGross'].values
    
     X_test = raw_test_data.ix[:,cols]
     y_test = raw_test_data['adjGross'].values
    
    • 使用pandas to_dict() 将DataFrame转化成Dict
    # Convert DataFrame to dict See more: http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/generated/pandas.DataFrame.to_dict.html#pandas.DataFrame.to_dict
    dict_X_train = X_train.to_dict(orient='records')
    dict_X_test = X_test.to_dict(orient='records')
    
    vec = DictVectorizer()
    X_train = vec.fit_transform(dict_X_train).toarray()
    X_test = vec.fit_transform(dict_X_test).toarray()
    
    • 最后,把train data喂给fit()函数,用score()函数检验模型在test data上的表现!
     clf = tree.DecisionTreeClassifier()
     clf = clf.fit(X_train,y_train)
    
     score = clf.score(X_test,y_test)
    
    • 当然也可以把tree导出到dot文件中,使用GraphViz画图
    from sklearn.externals.six import StringIO
    with open("文件名称.dot", 'w') as f:
        f = tree.export_graphviz(clf, out_file=f, feature_names= vec.get_feature_names())
    

    在CLI上输入如下命令:
    $ dot -Tps tree.dot -o tree.ps (PostScript 格式)
    $ dot -Tpng tree.dot -o tree.png (PNG 格式)

    • 最后附上两张tree图,分别是没有设置max_depth以及设置max_depth=8的情形


      tree_with_8_depth
      tree_without_limit_depth
    • 网上有很多流行的数据集,比如简书上的《最流行的4个机器学习数据集》

    • 我使用的是UCI上一个判断年工资是否大于50k的数据集


    结语

    • 这是第一次使用Python进行data mining,学习使用Python断断续续也有大半年,从写简单的算法课作业,后来写爬虫,接触Flask写网站, 不断体会到“人生苦短,我用Python”。这当然基于Python非常完善的代码库。
    • 没有一种语言是万能的,Python当然也不是,但不得不说在某些领域Python确实作为一种高级语言,可以让你更专注你核心要做的事情, 而非语言本身。

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      网友评论

      • 幽灵漫步:grep一下"?"有的数据以一个?号表示的
        你用sklearn 直接把 ?号加载进去就相当于把“?”号当成某一个数据值了
      • Jason_Yuan:@幽灵漫步 额,没明白“有缺失数据“怎么定义的。。。我道行不够深啊
      • 幽灵漫步:50k那个数据集有缺失数据,你怎么处理

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