学习小组Day5笔记--AOK

作者: AOK | 来源:发表于2022-03-08 10:20 被阅读0次
生信星球Day5-数据结构.png

数据结构

  1. R的赋值符号是<-
  2. R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
  3. 显示工作路径 getwd()
  4. 向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
  5. 表格在R语言中改名叫数据框_
  6. 函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
  7. 数据类型:
    (1) 向量(vector)
    (2) 矩阵(Matrix)
    (3) 数组(Array)
    (4) 数据框(Data frame)
    (5) List
  • 主要介绍向量和数据库

一、向量

1. 元素、标量和向量

  • 先用一张图理解一下
From 生信星球
  • 赋值
能发现后面的值覆盖了前面

2. 从向量中提取元素

(1)根据元素位置

注意对比.png
(2)根据
x出现在[ ] 里面

二、数据框

1. 读取本地数据

Snipaste_2022-03-08_23-48-32.png
  1. \t \r \n都是转义字符,空格就是单纯的空格,输入时可以输入空格
  2. \t 的意思是 :水平制表符。将当前位置移到下一个tab位置。
  3. \r 的意思是: 回车。将当前位置移到本行的开头。
  4. \n 的意思是:回车换行。将当前位置移到下一行的开头。
  5. \f的意思是:换页。将当前位置移到下一页的开头。

2. 设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
  • \color{SlateBlue}{为啥一个read table,一个read csv?}
read.table read.csv

3. 数据框的导出

write.table(X,file = "wonder.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 
  • 导出后会在默认文件夹里看到导出的数据框

4. 变量的保存与重新加载

这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="Life.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
  • 有的报错说不存在,如下图,很好理解,像X的话,你看是不是大小写搞混了,大X小x傻傻分不清楚
对象'A'不存在

5. 提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
  • 看看 的区别,其他格式同理
看逗号的位置

以上
From 生信星球学习小组第130期

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