Uniprot蛋白数据本地建立

下载相应的蛋白数据库（UniprotKB）

uniprotKB数据库：(https://www.uniprot.org/uniprot/）

进入UniProtKB网址
在搜索框中搜索你需要的职务的名称，进行搜索。
Download

在“Download”中进行下载，下载格式改为“FASTA (canonical & isoform),”

使用makeblastdb建库

#makeblastdb creat datebase
## UniportKB_
makeblastdb -in uniprot-Medicago+truncatula.fasta -dbtype prot -out UniprotKB_blastdb
## Swissprot_blastdb
makeblastdb -in uniprot-Medicago+truncatula.fasta -dbtype prot -out SwissProt_blastdb

结果得到

UnprotKB_blast
siwssprot_blastdb

Use blastx prediction the protein

blastx -db ../../../../UniprotKB/UniprotKB_blastdb -query non-coding-transcript.fa -evalue 1e-10 -out KB_output -outfmt 6