植物基因组网站Blast使用

作者: lxmic | 来源:发表于2018-10-31 23:03 被阅读107次
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    因为做番茄的缘故,很多时候就需要进行寻找基因序列等信息,还可能要寻找同源的其他物种比如拟南芥的序列,或者从拟南芥来寻找番茄中的序列。今天主要的就是来讲从拟南芥来寻找番茄的同源基因。今天我又发现,如果没有记录,那么一个问题你会犯无数次的错,或者你会无数遍记不得你曾经是怎么做的,现在也是年纪大了,整个人的忆能力真是下降的厉害。还是要做点笔记,方便很多,好记性不如烂笔头。

    首先,你要点击工具按钮

    tools

    接着点blast

    出现以下页面,选择你要比对的物种,这里我选择番茄,然后把拟南芥中的序列复制拷贝到里面

    修改两个参数

    然后开始运行,会得到一些结果

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      网友评论

      • 热衷组培的二货潜:这个的咦,请问这个的可靠性多大,我看bimoart也有,可以直接导出所有一个物种在另一个物种中的同源基因
        lxmic:@二货潜 不用客气
        热衷组培的二货潜:@lxmic :smiley: 经过实践真的特别好用:smiley: 这个能看信息,biomart只是在结果里面直接找对饮的基因,多谢分享
        lxmic:@二货潜 这个我觉得挺可靠,我们基本用这个

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