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陈巍学基因视频学习笔记--视频10:单细胞DNA测序

陈巍学基因视频学习笔记--视频10:单细胞DNA测序

作者: 冻春卷 | 来源:发表于2020-02-04 18:13 被阅读0次

    前期笔记

    陈巍学基因视频学习笔记--视频1:Illumina测序化学原理
    陈巍学基因视频学习笔记--视频7:RNA-seq方法和应用
    陈巍学基因视频学习笔记--视频8:外显子测序
    陈巍学基因视频学习笔记--视频9:small RNA-seq

    单细胞DNA测序的目的就是要一个细胞能做到全基因组测序。

    要克服的困难:
    (1)随机引物PCR扩增,由于扩增效率不同,则扩增不均一;
    (2)全基因组覆盖问题:常规的打断,加接头等操作会损失DNA,这是不可接受的,这里要求几乎所有的原始DNA都要被扩增并且检测到。
    (3)要有较高的扩增效率:普通的方法,2万个文库,只有一个会被结合在flowcell上。

    解决办法:
    (1)MALBAC:均一性更好,扩增效率相对较低


    image.png

    (2)MDA:扩增效率高,简单


    image.png

    互相比较:

    image.png image.png

    由于单细胞测序在近几年得到了爆炸性的进步,因此对于2015年的视频,我则是不看那么详细了。

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