题外话:这是之前身负剽窃争议的杨辉研究员的新作。且不论过往,这项工作还是挺有意义的。
CRISPR/Cas9的大名自不用多说,而靶向RNA的CRISRP/Cas13系统也已经不断被发现,并且其中一些表现出很强大的RNA沉默功能。但和CRISPR/Cas9的缺点一样,已经发现的的Cas13都比较大,临床应用上比较受限制,因此鉴定mini版的Cas13是该领域的一个重要研究方向。今天要分享的Cas13X/Y就是一类新鉴定的miniCas13蛋白,在RNA沉默和编辑效率上可以媲美早前鉴定的RfxCas13d。
Cas13家族三言两语
1.使用未培养细菌的宏基因组数据鉴定到miniCas13——CasX/Y。
2.将miniCas13进行密码子优化以及添加NLS(核定位信号)后,可以实现有效的RNA沉默,其高活性和高特异性效果媲美RfxCas13d。
3.miniCas13同样可以应用与抗RNA病毒,尤其是利用少量错配碱基也能有效抑制RNA的特点,可以实现利用少量crRNA实现多种RNA病毒的抑制。(PS.这里有点奇怪,这种对于错配耐受的特点难道不是说明其特异性不是很高,对于存在单碱基亦或少量碱基不同的RNA,其可能均有沉默效果,即脱靶)。
4.miniCas13可以进一步去除一些序列变得更小,再与RNA编辑相关蛋白偶联,实现RNA的碱基编辑。
Reference
Xu, C. et al. Programmable RNA editing with compact CRISPR–Cas13 systems from uncultivated microbes. Nature Methods (2021).
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