二月剿匪略有进展，但收获不大，王阳明写信给徐爱，询问弟子闻人诠（字邦正）的哥哥闻人赞能不能前来助力军事，并称等战事稍定，即申请退归故里，并盼望徐爱和王琥（字世瑞）能来和自己相会。
他又嘱托徐爱好好教诲二弟王守文，而嗣子王正宪资质愚钝，只要能知孝悌、守门户即可，不可追名逐利，并问候各位故交，思乡之情溢于言表。
二月二十九日，王阳明亲自带领精兵二千，从赣州进军福建汀州，晓谕各地驻军配合。他假称班师，在班师途中突然攻袭象湖等匪寨，再破可塘等寨，势如破竹，此次汀州-上杭战役，至四月份结束，共攻破贼巢三十余处，斩首1420余，俘贼570余，烧毁匪屋2000余间，战利品无数，招抚脇从贼人1235名、家属2828人。
时值上杭地区大旱，王阳明在上杭行台组织祈雨祭祀，作《祈雨辞》、《祈雨诗》。
四月五日开始果然连下三天大雨。原绍兴知府梁乔于正德十年以母老归家上杭，四月五日，王阳明游南泉庵，他便携酒来访，王阳明作诗《南泉庵漫书》并题于壁。
山城经月驻旌戈，亦复幽寻到薜萝。
南国已看回甲马，东田初喜出农簑。
溪云晓渡千峰雨，江涨春深两岸波。
暮倚七星瞻北极，絶怜苍翠晚来多。
王阳明高兴之余，还拜谒了《晦翁祠》。王阳明虽然为剿匪而来，这一期间多次举行祈雨活动，体现了他剿匪必先安民的思想。
五月八日，王阳明回到赣州治所，上《闽广捷音疏》，申明赏罚，同时给兵部尚书王琼写信，报告战果，请求犒赏部队，积蓄力量，为秋冬发动对湖南、广西境内的匪巢发动攻势作准备，并请授予专一之权。待秋冬战罢，乞归山林。
王阳明认为，荡平匪患绝非仅凭武功所能致，于是他整编队伍，建立兵符制；上《攻治盗贼二策疏》、《类奏擒斩功次疏》；上《添设清平县治疏》，建议新设平和县，加强地方治理。
五月底，王阳明再次给兵部尚书王琼写信，他说福建境内的匪患虽以解除，但南昌、赣州的匪徒数倍于闽，而且处于四省交界之处，但巡抚不能干预地方民事，自己的号令实际只在赣州城有效，并且也受地方行政机关的掣肘。因此请求撤销对南赣巡抚的限制，改以统制两广，至少任江西巡抚，一应车马钱粮，都由巡抚统一裁处。剿匪是为了安民，安民又是剿匪的关键。现在只让我剿匪，不让染指民事，就像医生看病只管用药，却不管病人饮食调养。
王阳明同时给旧识、文渊阁大学士、礼部尚书毛纪（字维之，号砺庵）写信，表达了同样的诉求。
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