作者:白介素2
只有获得了SEER数据库的下载权限之后呢,就可以自由的下载SEER数据库中的数据了,下面可以step by step的操作来看下有哪些数据下载方式,如何获得数据下载权限:
数据下载方式
首先来到 SEER数据获取的界面:https://seer.cancer.gov/data/access.html
image.png点击一下获取数据与 SEERstat****软件*的链接了解更多详细的信息,我们继续来看下界面内容:
image.png image.png综上,其实官方的态度已经很明确了,这里推荐使用 SEERStat****软件*下载数据,这样会比较方便简单些,何必去自寻烦恼,至少像白介素同学的目的很简单,就是想要获取自己读的懂的数据,用于后续分析。如果可能,我甚至不希望有自己去下载数据的过程。当然了,这是不可能滴,至少目前来看是这样。
有哪些数据可供下载
继续回到SEER数据获取界面:https://seer.cancer.gov/data/access.html
我们很容易看到通过软件客户端能获取的数据更多,而另一种更复杂格式的数据
image.png这里着重介绍下 Specialized SEER datasets,这就是一部分只能通过 SEERStat*软件下载,例如图中标注的放化疗的数据,基因检测的数据等等。
image.png值得注意的是,这些数据的使用是有一定的要求的,相对普通的数据申请呢又要更困难一些,包括申请者自己的信息,研究意义,需要哪些数据,研究计划,要通过邮件的形式发送到指定邮箱:seercustomdata@imsweb.com。然后由对方审核。
image.png数据使用申请
这是 SEER数据使用的协议,大概的流程是这样,先提交申请,注册,然后下载一个文件,自己手写签名后,扫描发送到指定邮箱,然后对方会在两个工作日内处理申请,如果申请成功,你的邮箱就会收到一个账号和密码的邮件,这也就意味着你获得了 SEER数据的下载权限。
image.png看下提交申请,注册的流程大概需要填写哪些内容吧:
image.png可以看到其实与普通的注册没啥两样的,自己点击提交即可。
image.png提交了之后呢,就会收到一封邮件,给你数据使用协议的链接,然后选择下载下来,读一读,签上自己名字之后,扫描发到指定邮箱,下面给大家看下白介素同学的看看:
image.png image.png这个字体有点斜了,见谅见谅,扫描时没有扫描好,顺便给大家安利一个App:全能扫描王。这样基本上就完成了数据的申请,获得了下载权限啦,总的来讲其实申请过程也不算难,稍稍花点心思就能拿下,没办法了,要用人家的数据,这点学习成本还是要的。
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