司马颖、司马乂、司马颙联合杀掉司马冏以后，司马乂在洛阳镇守，司马颖和司马颙各在自己的封地镇守。
这样的话，撺掇司马颙讨伐司马冏的李含，他的阴谋就没有得逞。他的想法是杀掉司马冏，司马颖控制朝廷，借机废掉慧帝，拥立司马颖，让司马颙担任宰相，自己就可以执掌朝廷大权。
结果事与愿违，现在是司马乂控制整个禁城，必须除掉司马乂，自己的计划才能得逞。
李含一计不成又生一计，当时皇甫商是司马乂的参军，皇甫商的哥哥皇甫重是秦州刺史 自然也算是司马乂的人。李含就给司马颙出主意说，皇甫重将来迟早会成为您的祸患，应该找机会除掉他，司马颙就真信了。
结果皇甫重不知从哪里得到了这个消息，不干了，召集部队讨伐李含。
司马乂不想事情闹大，就命令二人取消军事行动，李含听从了命令，而皇甫重忍不了，就没听。
司马颙就不干了，让你俩停手，朝廷的命令也敢不听？就命令金城太守游楷，陇西太守韩稚讨伐皇甫重。
同时司马颙又密令李含联系侍中冯荪、中书令卞粹谋杀司马乂，皇甫商知道了这个消息，就通知了司马乂。
司马乂这个气呀，他俩人闹矛盾，你朝我下狠手，看来你这是想的挺多呀！就命令把李含、冯荪、卞粹统统杀掉了。
骠骑从事诸葛玫，前司徒长史牵秀吓得投奔了司马颖。
这下大家都撕破脸了，河间王司马颙起兵讨伐司马乂，大将军司马颖也借机平定叛乱，起兵讨伐司马乂，还给慧帝上奏说，司马乂不公正，羊玄之、皇甫商独揽朝政，应该杀掉，把司马乂遣送封国。
晋慧帝不同意这样的说法，认为司马颖和司马颙在胡说八道，说如果你们起兵，我就御驾亲征。
司马颖和司马颙根本不听，司马颙派张方率领七万人向东，逼近洛阳，司马颖派陆机位前锋，王粹、牵秀、石超带领二十多万人从南方逼近洛阳。
慧帝亲征，司马乂派皇甫商派一万余人抵抗张方，被张方打败，慧帝亲征不再京城，张方进入京城，大肆劫掠，屠城，数万人死于非命。
在此期间，三方你来我往，打的不亦乐乎，司马乂的战斗力真的强，司马颖和司马颙的部队也不团结，派系斗争也严重，前锋都督陆机因为资历不足，打了败仗被孟玖、孟超兄弟诬陷，死于非命。
朝廷派王衍进行调解，希望司马颖和司马乂分陕而治，司马颖不同意，司马乂也给司马颙写信，希望和解，不要再打了，司马颖就提了个条件说，你杀了皇甫商我就退兵，司马乂不干，和谈失败。
张方断了京城的水源，朝廷征发一品以下的官员和家属全部服劳役，为前线服务，同时向全国各地发布檄文，援救京城，各地纷纷响应。
司马乂派皇甫商游说游楷退兵，结果被他的堂外甥告发，司马颙抓住了并且杀掉了皇甫商。
皇甫商死了，战争并没有停止，前后伤亡了六七万人，但是京城粮食日益窘迫，但是防守依然坚固，张方抗不住了，想退兵。
在这个关键时刻，司马乂的内部被攻破。原来东海王司马越有要求，司马乂没有满足，就和司马乂闹了矛盾，连夜联合各将领发动兵变，逮捕了司马乂，关进了金墉城。
官兵投降，发现城外的部队都是乌合之众，十分后悔，就计划把司马乂从金墉城劫出来继续抵抗司马颙，司马越很害怕，万一司马乂出来，自己岂不是死无葬身之地了，就想杀了司马乂，绝了大家的念想。
黄门侍郎就出了一个主意说，你不能自己动手，否则无法统率将领。
于是派人通知张方，说司马乂在金墉城。张方来到金墉城，抓走司马乂，然后就把司马乂烧烤了，人人都替司马乂惋惜。
司马颖进入，再次执掌朝政，将和自己结怨的官员，全部杀掉，晋朝依然混乱不堪，毫无秩序。
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