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FMRI任务态SPM分析流程_点击操作

FMRI任务态SPM分析流程_点击操作

作者: 莫浪愁 | 来源:发表于2022-09-07 17:35 被阅读0次

    一、任务态数据结构

    分组 样本量 格式 数据维度
    RW(rested wakefullness) 37 nii 4
    SD(sleep deprivation) 37 nii 4

    样式:


    1
    2

    二、处理流程

    1.将4D文件转换为3D

    目的:共220个时间点,由于头动适应及实验设计,需去除前3个时间点。
    (1)在spm中复制batch,得到批处理代码。


    3

    (2)修改批处理代码——运用Excel自动填充和文本连接函数,word进行替换


    4
    5
    6
    7

    (3)运行TDD.m文件-得到3d数据

    2.将数据进行预处理与一阶个体spm任务态分析

    (1)运用spm,设计batch(需修改处已用红线标出)
    1>头动矫正


    8

    2>时间矫正(如果是Block设计不需要做,如果TR>3s也不推荐做)


    9

    3>coregister


    10

    4>segment


    11
    12

    5>Normalise


    13

    6>Smooth


    14

    7>fMRI model specification
    condition与实验设计相关
    此实验为Block设计,有两个条件speed task和baseline control。


    实验设计 15
    16
    17

    8>Model estimation


    18

    (2)导出script,批处理化
    由于每个被试需进行的步骤较多,所以每个被试单独设置一个_job.m文件便于后续执行。
    根据第一个被试,后续被试进行被试编号及文件夹的替换即可。
    而在运行.m文件中对每一个模块复制粘贴即可。

    3.剔除头动异常被试,进行二阶spm任务态分析

    (1)运用Dpabi预处理至头动矫正,可得到头动排除文件
    已经大于最大头动2.5mm,排除被试1,9,10,14,33。
    (2)Dpabi统计分析,进行配对检验

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