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FMRI任务态SPM分析流程_点击操作

FMRI任务态SPM分析流程_点击操作

作者: 莫浪愁 | 来源:发表于2022-09-07 17:35 被阅读0次

一、任务态数据结构

分组 样本量 格式 数据维度
RW(rested wakefullness) 37 nii 4
SD(sleep deprivation) 37 nii 4

样式:


1
2

二、处理流程

1.将4D文件转换为3D

目的:共220个时间点,由于头动适应及实验设计,需去除前3个时间点。
(1)在spm中复制batch,得到批处理代码。


3

(2)修改批处理代码——运用Excel自动填充和文本连接函数,word进行替换


4
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(3)运行TDD.m文件-得到3d数据

2.将数据进行预处理与一阶个体spm任务态分析

(1)运用spm,设计batch(需修改处已用红线标出)
1>头动矫正


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2>时间矫正(如果是Block设计不需要做,如果TR>3s也不推荐做)


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3>coregister


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4>segment


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5>Normalise


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6>Smooth


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7>fMRI model specification
condition与实验设计相关
此实验为Block设计,有两个条件speed task和baseline control。


实验设计 15
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8>Model estimation


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(2)导出script,批处理化
由于每个被试需进行的步骤较多,所以每个被试单独设置一个_job.m文件便于后续执行。
根据第一个被试,后续被试进行被试编号及文件夹的替换即可。
而在运行.m文件中对每一个模块复制粘贴即可。

3.剔除头动异常被试,进行二阶spm任务态分析

(1)运用Dpabi预处理至头动矫正,可得到头动排除文件
已经大于最大头动2.5mm,排除被试1,9,10,14,33。
(2)Dpabi统计分析,进行配对检验

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