scikit-learn基础介绍
估计器(Estimator)
可以直接理解成分类器
主要包含两个函数:fit(x,y) 和 predict(x),分别是训练和预测算法
模型流程:
# 拟合模型
model.fit(X_train, y_train)
# 模型预测
model.predict(X_test)
# 获得这个模型的参数
model.get_params()
# 为模型进行打分
model.score(data_X, data_y)
线性回归
from sklearn.linear_model import LinearRegression
# 定义线性回归模型
model = LinearRegression(fit_intercept=True, normalize=False, copy_X=True, n_jobs=1)
"""
fit_intercept:是否计算截距。False-模型没有截距
normalize: 当fit_intercept设置为False时,该参数将被忽略。 如果为真,则回归前的回归系数X将通过减去平均值并除以l2-范数而归一化。
n_jobs:指定线程数
"""
逻辑回归
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 定义逻辑回归模型
model = LogisticRegression(penalty=’l2’, dual=False, tol=0.0001, C=1.0,
fit_intercept=True, intercept_scaling=1, class_weight=None,
random_state=None, solver=’liblinear’, max_iter=100, multi_class=’ovr’,
verbose=0, warm_start=False, n_jobs=1)
"""
penalty:使用指定正则化项(默认:l2)
dual: n_samples > n_features取False(默认)
C:正则化强度的反,值越小正则化强度越大
n_jobs: 指定线程数
random_state:随机数生成器
fit_intercept: 是否需要常量
"""
朴素贝叶斯
from sklearn import naive_bayes
model = naive_bayes.GaussianNB()
model = naive_bayes.MultinomialNB(alpha=1.0, fit_prior=True, class_prior=None)
model = naive_bayes.BernoulliNB(alpha=1.0, binarize=0.0, fit_prior=True, class_prior=None)
"""
alpha:平滑参数
fit_prior:是否要学习类的先验概率;false-使用统一的先验概率
class_prior: 是否指定类的先验概率;若指定则不能根据参数调整
binarize: 二值化的阈值,若为None,则假设输入由二进制向量组成
"""
决策树
from sklearn import tree
model = tree.DecisionTreeClassifier(criterion=’gini’, max_depth=None,
min_samples_split=2, min_samples_leaf=1, min_weight_fraction_leaf=0.0,
max_features=None, random_state=None, max_leaf_nodes=None,
min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None,
class_weight=None, presort=False)
"""
criterion :特征选择准则gini/entropy
max_depth:树的最大深度,None-尽量下分
min_samples_split:分裂内部节点,所需要的最小样本树
min_samples_leaf:叶子节点所需要的最小样本数
max_features: 寻找最优分割点时的最大特征数
max_leaf_nodes:优先增长到最大叶子节点数
min_impurity_decrease:如果这种分离导致杂质的减少大于或等于这个值,则节点将被拆分。
"""
支持向量机SVM
from sklearn.svm import SVC
model = SVC(C=1.0, kernel=’rbf’, gamma=’auto’)
"""
C:误差项的惩罚参数C
gamma: 核相关系数。浮点数,If gamma is ‘auto’ then 1/n_features will be used instead.
"""
knn最近邻算法
from sklearn import neighbors
#定义kNN分类模型
model = neighbors.KNeighborsClassifier(n_neighbors=5, n_jobs=1) # 分类
model = neighbors.KNeighborsRegressor(n_neighbors=5, n_jobs=1) # 回归
"""
n_neighbors: 使用邻居的数目
n_jobs:并行任务数
"""
多层感知器
from sklearn.neural_network import MLPClassifier
# 定义多层感知机分类算法
model = MLPClassifier(activation='relu', solver='adam', alpha=0.0001)
"""
hidden_layer_sizes: 元祖
activation:激活函数
solver :优化算法{‘lbfgs’, ‘sgd’, ‘adam’}
alpha:L2惩罚(正则化项)参数。
"""
交叉验证
from sklearn.model_selection import cross_val_score
cross_val_score(model, X, y=None, scoring=None, cv=None, n_jobs=1)
"""
model:拟合数据的模型
cv : k-fold
scoring: 打分参数-‘accuracy’、‘f1’、‘precision’、‘recall’ 、‘roc_auc’、'neg_log_loss'等等
"""
检验曲线
from sklearn.model_selection import validation_curve
train_score, test_score = validation_curve(model, X, y, param_name, param_range, cv=None, scoring=None, n_jobs=1)
"""
model:用于fit和predict的对象
X, y: 训练集的特征和标签
param_name:将被改变的参数的名字
param_range: 参数的改变范围
cv:k-fold
"""
转换器(Transformer)
用于数据预处理和数据转换
主要函数有:transform(),还有fit_transform()将fit()和transform()结合在一起。
流水线(Pipeline)
sklearn.pipeline包
- 流水线的功能:
- 跟踪记录各步骤的操作(以方便地重现实验结果)
- 对各步骤进行一个封装
- 确保代码的复杂程度不至于超出掌控范围
基本使用方法
流水线的输入为一连串的数据挖掘步骤,其中最后一步必须是估计器,前几步是转换器。输入的数据集经过转换器的处理后,输出的结果作为下一步的输入。最后,用位于流水线最后一步的估计器对数据进行分类。
每一步都用元组( ‘名称’,步骤)来表示
scaling_pipeline = Pipeline([
('scale', MinMaxScaler()),
('predict', KNeighborsClassifier())
])
预处理(Preprocessing)
sklearn.preprocessing包
-
规范化:
- MinMaxScaler :最大最小值规范化
- Normalizer :使每条数据各特征值的和为1
- StandardScaler :为使各特征的均值为0,方差为1
-
编码:
- LabelEncoder :把字符串类型的数据转化为整型
- OneHotEncoder :特征用一个二进制数字来表示
- Binarizer :为将数值型特征的二值化
- MultiLabelBinarizer:多标签二值化
from sklearn import preprocessing
# 标准化处理函数
# 将数据转化为标准正态分布(均值为0,方差为1)
preprocessing.scale(X,axis=0, with_mean=True, with_std=True, copy=True)
# 将数据在缩放在固定区间,默认缩放到区间 [0, 1]
preprocessing.minmax_scale(X,feature_range=(0, 1), axis=0, copy=True)
# 数据的缩放比例为绝对值最大值,并保留正负号,即在区间 [-1.0, 1.0] 内。唯一可用于稀疏数据 scipy.sparse的标准化
preprocessing.maxabs_scale(X,axis=0, copy=True)
# 通过 Interquartile Range (IQR) 标准化数据,即四分之一和四分之三分位点之间
preprocessing.robust_scale(X,axis=0, with_centering=True, with_scaling=True,copy=True)
# 标准化正态分布类
#基于mean和std的标准化
class preprocessing.StandardScaler(copy=True, with_mean=True,with_std=True)
# 属性:
# scale_:ndarray,缩放比例
# mean_:ndarray,均值
# var_:ndarray,方差
# n_samples_seen_:int,已处理的样本个数,调用partial_fit()时会累加,调用fit()会重设
##########MinMaxScaler#############
# 将数据在缩放在固定区间的类,默认缩放到区间 [0, 1]
class preprocessing.MinMaxScaler(feature_range=(0, 1),copy=True):
# 属性:
# min_:ndarray,缩放后的最小值偏移量
# scale_:ndarray,缩放比例
# data_min_:ndarray,数据最小值
# data_max_:ndarray,数据最大值
# data_range_:ndarray,数据最大最小范围的长度
##########MaxAbsScaler##############
# 数据的缩放比例为绝对值最大值,并保留正负号,即在区间 [-1.0, 1.0] 内。可以用于稀疏数据scipy.sparse
class preprocessing.MaxAbsScaler(copy=True):
# 属性:
# scale_:ndarray,缩放比例
# max_abs_:ndarray,绝对值最大值
# n_samples_seen_:int,已处理的样本个数
############RobustScaler###################
# 通过 Interquartile Range (IQR) 标准化数据,即四分之一和四分之三分位点之间
classpreprocessing.RobustScaler(with_centering=True,with_scaling=True, copy=True):
# 属性:
# center_:ndarray,中心点
# scale_:ndarray,缩放比例
#################
# 生成 kernel 矩阵,用于将 svm kernel 的数据标准化
class preprocessing.KernelCenterer:
"""
fit(X[,y]):根据数据 X 的值,设置标准化缩放的比例
transform(X[,y, copy]):用之前设置的比例标准化 X
fit_transform(X[, y]):根据 X设置标准化缩放比例并标准化
partial_fit(X[,y]):累加性的计算缩放比例
inverse_transform(X[,copy]):将标准化后的数据转换成原数据比例
get_params([deep]):获取参数
set_params(**params):设置参数
"""
特征工程
主要包括特征提取(Feature Extraction)和特征选择(Feature Selection)
-
sklearn.select_extraction
- DictVectorizer: 将dict类型的list数据,转换成numpy array
- FeatureHasher : 特征哈希,相当于一种降维技巧
- image:图像相关的特征抽取
- text: 文本相关的特征抽取
- text.CountVectorizer:将文本转换为每个词出现的个数的向量
- text.TfidfVectorizer:将文本转换为tfidf值的向量
- text.HashingVectorizer:文本的特征哈希
-
sklearn.feature_selection
(1)降低复杂度
(2)降低噪音
(3)增加模型可读性- VarianceThreshold: 删除特征值的方差达不到最低标准的特征
- SelectKBest: 返回k个最佳特征
- SelectPercentile: 返回表现最佳的前r%个特征
单个特征和某一类别之间相关性的计算方法:卡方检验(χ2)、互信息和信息熵
降维(Decomposition)
主要是PCA
- sklearn.decomposition
主成分分析算法(Principal Component Analysis, PCA)的目的是找到能用较少信息描述数据集的特征组合。它意在发现彼此之间没有相关性、能够描述数据集的特征,同时起到数据压缩作用
组合(Ensemble)
通过聚集多个分类器的预测来提高分类准确率
- sklearn.ensemble
常用的组合分类器方法:
(1)通过处理训练数据集。即通过某种抽样分布,对原始数据进行再抽样,得到多个训练集。常用的方法有装袋(bagging)和提升(boosting)。
装袋(bagging):
根据均匀概率分布从数据集中重复抽样(有放回),每个自助样本集和原数据集一样大,每个自助样本集含有原数据集大约63%的数据。训练k个分类器,测试样本被指派到得票最高的类。
提升(boosting):
通过给样本设置不同的权值,每轮迭代调整权值。
不同的提升算法之间的差别,一般是(1)如何更新样本的权值,(2)如何组合每个分类器的预测。
其中Adaboost中,样本权值是增加那些被错误分类的样本的权值,分类器C_i的重要性依赖于它的错误率。
Boosting主要关注降低偏差,因此Boosting能基于泛化性能相当弱的学习器构建出很强的集成;Bagging主要关注降低方差,因此它在不剪枝的决策树、神经网络等学习器上效用更为明显。
偏差指的是算法的期望预测与真实预测之间的偏差程度,反应了模型本身的拟合能力;方差度量了同等大小的训练集的变动导致学习性能的变化,刻画了数据扰动所导致的影响
(2)通过处理输入特征。即通过选择输入特征的子集形成每个训练集。适用于有大量冗余特征的数据集。随机森林(Random forest)就是一种处理输入特征的组合方法。
(3)通过处理类标号。适用于多分类的情况,将类标号随机划分成两个不相交的子集,再把问题变为二分类问题,重复构建多次模型,进行分类投票。
BaggingClassifier: Bagging分类器组合
BaggingRegressor: Bagging回归器组合
AdaBoostClassifier: AdaBoost分类器组合
AdaBoostRegressor: AdaBoost回归器组合
GradientBoostingClassifier:GradientBoosting分类器组合
GradientBoostingRegressor: GradientBoosting回归器组合
ExtraTreeClassifier:ExtraTree分类器组合
ExtraTreeRegressor: ExtraTree回归器组合
RandomTreeClassifier:随机森林分类器组合
RandomTreeRegressor: 随机森林回归器组合
模型评估(度量)Metrics
sklearn.metrics包含评分方法,性能度量,成对度量和距离计算。
分类结果度量
参数大多是y_true和y_pred。
- accuracy_score:分类准确度
- condusion_matrix :分类混淆矩阵
- classification_report:分类报告
- precision_recall_fscore_support:计算精确度、召回率、f、支持率
- jaccard_similarity_score:计算jcaard相似度
- hamming_loss:计算汉明损失
- zero_one_loss:0-1损失
- hinge_loss:计算hinge损失
- log_loss:计算log损失
其中,F1是以每个类别为基础进行定义的,包括两个概念:准确率(precision)和召回率(recall)。准确率是指预测结果属于某一类的个体,实际属于该类的比例。召回率是被正确预测为某类的个体,与数据集中该类个体总数的比例。F1是准确率和召回率的调和平均数。
回归结果度量
- explained_varicance_score:可解释方差的回归评分函数
- mean_absolute_error:平均绝对误差
- mean_squared_error:平均平方误差
多标签的度量
- coverage_error:涵盖误差
- label_ranking_average_precision_score:计算基于排名的平均误差Label ranking average precision (LRAP)
聚类的度量
- adjusted_mutual_info_score:调整的互信息评分
- silhouette_score:所有样本的轮廓系数的平均值
- silhouette_sample:所有样本的轮廓系数
交叉验证(Cross validation)
sklearn.model_selection
model_selection
- KFold:K-Fold交叉验证迭代器。接收元素个数、fold数、是否清洗
- LeaveOneOut:LeaveOneOut交叉验证迭代器
- LeavePOut:LeavePOut交叉验证迭代器
- LeaveOneLableOut:LeaveOneLableOut交叉验证迭代器
- LeavePLabelOut:LeavePLabelOut交叉验证迭代器
LeaveOneOut(n) 相当于 KFold(n, n_folds=n) 相当于LeavePOut(n, p=1),
LeaveP和LeaveOne差别在于leave的个数,也就是测试集的尺寸,
LeavePLabel和LeaveOneLabel差别在于leave的Label的种类的个数。 - 其他方法
- train_test_split:分离训练集和测试集(不是K-Fold)
- cross_val_score:交叉验证评分,可以指认cv为上面的类的实例
- cross_val_predict:交叉验证的预测
# 将数据集分为训练集和测试集
from sklearn.mode_selection import train_test_split
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3, random_state=42)
# arrays:样本数组,包含特征向量和标签
# test_size:
# float-获得多大比重的测试样本 (默认:0.25)
# int - 获得多少个测试样本
# train_size: 同test_size
# random_state: int - 随机种子(种子固定,实验可复现)
# shuffle - 是否在分割之前对数据进行洗牌(默认True)
网格搜索
网格搜索最佳参数 sklearn.model_selection
from sklearn.model_selection import GridSearchCV
Tuning the hyper-parameters of an estimator
- GridSearchCV:搜索指定参数网格中的最佳参数
- ParameterGrid:参数网格
- ParameterSampler:用给定分布生成参数的生成器
- RandomizedSearchCV:超参的随机搜索 通过best_estimator_.get_params()方法,获取最佳参数
多标签分类
sklearn.multiclass
Multiclass
- OneVsRestClassifier:1-rest多分类(多标签)策略
- OneVsOneClassifier:1-1多分类策略
- OutputCodeClassifier:1个类用一个二进制码表示
模型保存
# 保存为pickle文件
import pickle
# 保存模型
with open('model.pickle', 'wb') as f:
pickle.dump(model, f)
# 读取模型
with open('model.pickle', 'rb') as f:
model = pickle.load(f)
model.predict(X_test)
#################################################
# sklearn自带方法joblib
from sklearn.externals import joblib
# 保存模型
joblib.dump(model, 'model.pickle')
#载入模型
model = joblib.load('model.pickle')
主要模块分类
1.sklearn.base: Base classes and utility function基础实用函数
2.sklearn.cluster: Clustering聚类
3.sklearn.cluster.bicluster: Biclustering 双向聚类
4.sklearn.covariance: Covariance Estimators 协方差估计
5.sklearn.model_selection: Model Selection 模型选择
6.sklearn.datasets: Datasets 数据集
7.sklearn.decomposition: Matrix Decomposition 矩阵分解
8.sklearn.dummy: Dummy estimators 虚拟估计
9.sklearn.ensemble: Ensemble Methods 集成方法
10.sklearn.exceptions: Exceptions and warnings 异常和警告
11.sklearn.feature_extraction: Feature Extraction 特征抽取
12.sklearn.feature_selection: Feature Selection 特征选择
13。sklearn.gaussian_process: Gaussian Processes 高斯过程
14.sklearn.isotonic: Isotonic regression 保序回归
15.sklearn.kernel_approximation: Kernel Approximation 核 逼近
16.sklearn.kernel_ridge: Kernel Ridge Regression 岭回归ridge
17.sklearn.discriminant_analysis: Discriminant Analysis 判别分析
18.sklearn.linear_model: Generalized Linear Models 广义线性模型
19.sklearn.manifold: Manifold Learning 流形学习
20.sklearn.metrics: Metrics 度量 权值
21.sklearn.mixture: Gaussian Mixture Models 高斯混合模型
22.sklearn.multiclass: Multiclass and multilabel classification 多等级标签分类
23.sklearn.multioutput: Multioutput regression and classification 多元回归和分类
24.sklearn.naive_bayes: Naive Bayes 朴素贝叶斯
25.sklearn.neighbors: Nearest Neighbors 最近邻
26.sklearn.neural_network: Neural network models 神经网络
27.sklearn.calibration: Probability Calibration 概率校准
28.sklearn.cross_decomposition: Cross decomposition 交叉求解
29.sklearn.pipeline: Pipeline 管道
30.sklearn.preprocessing: Preprocessing and Normalization 预处理和标准化
31.sklearn.random_projection: Random projection 随机映射
32.sklearn.semi_supervised: Semi-Supervised Learning 半监督学习
33.sklearn.svm: Support Vector Machines 支持向量机
34.sklearn.tree: Decision Tree 决策树
35.sklearn.utils: Utilities 实用工具
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