文献信息：
标题：Identification of Natural CRISPR Systems and Targets in the Human Microbiome
杂志：Cell Host & Microbe
时间：2021.1.13
通讯：Alice C. McHardy & Curtis Huttenhower
单位：Harvard School of Public Health
背景
细菌cas酶切割外源病毒序列（类似免疫作用保护自己），切完将病毒pam序列作为抗原表位（epitope）插到自身基因组cripr repeat序列中，改名为spacer序列，形成”免疫记忆”，再此遇到相同pam序列的病毒基因组，免疫细菌能快速合成cas攻击病原体。
CRISPR 到底是一种怎样的技术？
crispr-spacer模式图
主要工作
作者利用来自200多人的17个部位的2000多份宏基因组测序样本，进行spacer预测，cas基因注释分析。
整体描述，口腔细菌丰度与细菌spacer丰度看似有关。样本spacer PCOA显示stool spacer最为特殊。
宏基因组cas酶物种来源展示
工具一览
网友评论