波斯尼亚和黑塞哥维那共和国（简称波黑），是巴尔干半岛西部的一个多山国家，首都为萨拉热窝。1992年独立前，曾是组成前南斯拉夫联邦的六个共和国之一，人口近440万，主要有信奉伊斯兰教的穆斯林族、信奉东正教的塞尔维亚族和信奉天主教的克罗地亚族。
历史上，民族、宗教、领土的冲突，使生活在波黑的塞族、克族、穆斯林之间积累了太多的恩怨与仇恨，冷战结束后，在前南斯拉夫联邦解体过程中暴发的波黑战争是第二次世界大战后在欧洲爆发的规模最大、最为残酷的种族战争。波黑战争期间以美、英、法、德为主的北约国家的干预对战争的升级起了推波助澜的作用。从1992年4月到1995年12月，战争持续了将近4年，波黑85%以上的经济设施遭到破坏，直接经济损失超过1000亿美元，经济倒退数十年。
1995年11月21日，原南斯拉夫地区三方最高领导人——前南斯拉夫塞尔维亚共和国总统（代表波黑塞尔维亚族）、克罗地亚共和国总统（代表波黑克罗地亚族）和波黑总统（代表波什尼亚克族）在美国代顿草签了《波黑和平框架协议》（亦称《代顿协议》），从而结束了长达三年多的波黑战争。
波黑战争结束后，1999年3月24日至6月10日，以美国为首的北约在未经联合国授权的情况下利用科索沃民族问题对南联盟进行了为期78天的空袭，贝尔格莱德等8个城市及其附近的军事目标遭到轰炸。为避免遭受更大的损失，南联盟决定与北约进行停战谈判。最终，联合国安理会通过了由西方八国和俄罗斯共同提交的关于政治解决科索沃问题的第1244号决议草案，至此，北约宣布战争结束。北约对南联盟的轰炸，是第二次世界大战结束以来欧洲所发生的最大浩劫，也可以说是20世纪行将结束前人类文明社会中最严重的人道主义灾难。
电影《深入敌后》根据发生在波黑战争期间的真实事件改编。
波黑战争期间，联合国授权在内战频仍的波黑地区建立禁飞区，以控制其境内的内战和人道危机升级。在此期间，北约空军击落了五架闯入禁飞区轰炸的塞族战斗机。
影片从地中海的美军“卡尔文森”号航空母舰开始，圣诞节将至，随着波黑停火的《代顿协议》签署，和平也即将来临。抱着拯救人类理想来做海军飞行员的克里斯·伯内特，因为条令约束却一直没有找到实战出动的机会，在安全员默许下，无聊到用航母蒸汽弹射器来打橄榄球的地步——航母逆风行驶时，近五十公里的强风足以将弹射出去的橄榄球吹回。这个小段落展现了美军现役的F/A-18F“超级大黄蜂”战机最典型的起飞前作业，发动机、操纵系统、仪表和设备检查工作一气呵成，飞行员们终于等到了一次相对平淡的侦察任务。
影片中，克里斯·伯内特和一名僚机驾驶员驾驶“超级大黄蜂”从“卡尔文森”号航空母舰上起飞到波斯尼亚的上空执行侦察任务时，意外地在非军事区拍到了民兵武装屠杀平民的证据。米洛斯拉夫·洛卡尔领导的塞族军队担心美军有可能发现隐蔽在这一区域的大片平民坟墓，用防空导弹成击落了伯内特驾驶的飞机，但飞行员伯内特跳伞逃生后躲过了民兵的追捕，以野菜和爬虫为食，用海绵吸取雨水求生，在塞族控制区隐藏了六天后被美军成功救走回。
《深入敌后》再现了残酷的波黑战场：遍布城郊、厂矿的地雷，踩中者尸骨无存，以及隐藏在密林中的万人坑，在整个波黑内战中共有近二十八万人死亡，超过二百万人流离失所。
影片中，伯内特拍摄到的万人坑，经发掘后，具体情况如下：
波斯尼亚最大的集体墓葬地中发掘出1000多具1995年斯雷布列尼察大屠杀的遇难者尸骨。
发掘小组组长穆拉特·忽尔提克说，“这是迄今为止在波黑地区发现的最大的集体墓葬地。”这些尸骨都被严重损坏，这种情况在“二级”集体墓葬地中非常典型，这是因为屠杀者为了隐瞒罪行，将尸体从原先的埋葬地点转移到了其它地方。
专家们除了发现这些尸骨以外，还发现了14份文件。这些文件显示，这些遇难者死于斯雷布列尼察大屠杀。这是第二次世界大战结束以来欧洲最残忍的大屠杀。1995年，塞族部落入侵了波斯尼亚的飞地斯里布瑞尼卡。这块地区是联合国规定的安全地带。塞族士兵杀害了8000名穆斯林成年男性和男孩。
从那以后，发掘小组在波斯尼亚全境发现了数个集体墓葬地，收集尸体并进行DNA检测，以确定死者的亲属关系。一旦他们确定了死者的身份和亲属关系，就将尸骨交还给其家庭成员进行埋葬。
发掘小组说，他们在死者身体里发现了子弹，已经用来捆绑被害者臂膀的塑料绳和布条。
在已经发掘出来的3500具大屠杀遇难者尸体中，已经有2500具尸体经过DNA检测确认身份。约2000具尸体被埋葬在斯雷布列尼察郊区的博托卡利。人们在这里最后一次看见他们。后来，他们在这里被塞族士兵包围并屠杀。
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