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生信星球学习小组第80期 Day6 — 路小悠

生信星球学习小组第80期 Day6 — 路小悠

作者: 路小悠 | 来源:发表于2020-09-20 09:39 被阅读0次

安装和加载R包

  • 镜像设置
    options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
    options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

  • 安装
    CRAN install.packages(“包”)
    bioconductor BiocManager::install(“包”)

  • 加载
    library(包)
    require(包)

dplyr基础函数实战

  • 新增列 mutate()
  • 按列筛选 select()
  • 筛选行 filter()
  • 按某1列或某几列对整个表格进行排序 arrange()
  • 汇总 summarise()

dplyr实用技能

  • 管道操作 %>%
  • 统计某列的unique值 count

dplyr处理关系数据

  • 取交集 inner_join
  • 左连left_join
  • 全连full_join
  • 半连接：返回能够与y表匹配的x表所有记录 semi_join
  • 反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录 anti_join
  • 合并 bind

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