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生信星球学习小组第80期 Day3 — 路小悠

生信星球学习小组第80期 Day3 — 路小悠

作者: 路小悠 | 来源:发表于2020-09-16 22:53 被阅读0次

linux环境下软件安装的准备工作

认识并下载miniconda

wget命令

miniconda的安装

安装 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
激活 source ~/.bashrc

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添加镜像

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conda入门

  • 查看当前服务器上安装的所有软件 conda list

    image.png
  • 搜索conda软件 conda search fastqc

    image.png
  • 安装软件 conda install fastqc -y

  • 卸载软件 conda remove fastqc -y

构建conda环境

  • 查看环境 conda info --envs

  • 构建新环境,同时安装软件 conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

    image.png
  • 激活新环境 conda activate rna-seq

    image.png base变rna-seq
  • 退出当前环境 conda deactivate

    image.png

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