生物信息为什么要学Linux

作者: bioschool点cn | 来源:发表于2024-01-14 18:11 被阅读0次

1. 计算需要

生物信息学是一门大数据专业,对计算资源有很高的要求,我们的笔记本电脑往往无法满足分析需求。如基因组组装,需要1T内存,20T存储;常用的基因组比对也往往需要十几个线程,几十G的内存。这些都需要服务器才能满足。Linux是服务器上最常用的操作系统。

2. 操作方便

Linux系统里面集成了很多数据分析及文件处理时的小工具,如grep awk le等命令。对于执行重复性操作的部分也可以通过编写脚本的方式实现,例如对成百上千个样本进行转录组分析,编写好脚本之后使用for循环即可实现。

3. 服务器运维

除非单位没有专门的IT人员,一般情况下是不需要生物信息从业人员去专门负责服务器运维的。只需要简单了解服务器使用规则就可以满足日常大部分的分析需求。

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