vcftools计算Fst

vcftools --vcf ld0818_0.5.vcf --weir-fst-pop far2.txt --weir-fst-pop far1.txt --out 21_fst_win --fst-window-size 50
vcftools --vcf ld0818_0.5.vcf --weir-fst-pop far_hn.txt --weir-fst-pop far3.txt --out hn3_fst 

VCFTOOLS官网,此步骤用于计算 Weir 和 Cockerham 1984 年论文中的 Fst 估计值，这是 Fst 的首选计算方法。

两篇少样本数量不影响Fst文献
两篇少样本数量不影响Fst文献