柱形图是最常见的图形，Excel画也很方便，但是一些调整细节还是挺繁琐的，这个工具的主要目的是便捷的调整柱形图。使用ggplot2包
整体界面
image
准备数据：标准的丰度表格，也可以加分组用来分面画图。
image
数据转换：可以把数据均一化到一百，也可以使用原始数据。
合并低丰度为Others：当变量比较多时，把低丰度变量加在一起。
image.gif
调整变量顺序：比如我们比较关注OTUy,把OTUy放到最小面，并按分组中大小排序。
image.gif
翻转坐标
image
极坐标
image
按变量分面，适合变量较少的情况，分面后可以直观展示各变量在每个样本中变化情况。
image
当变量较少时，可以按变量和分组分面
image.gif
加上聚类，支持十几种距离和聚类方法，使用“vegan::vegdist和hclust”。聚类树可视化使用ggtree。
image.gif
修改柱子宽度
image
图例位置调整，放到底部
image
配色调整，各种杂志配色，使用ggsci。
image
暂时能想到的功能就这些了，后面有需要再优化，欢迎小伙伴们提出建议。
image
网友评论