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学习小组Day3笔记--strengthen

学习小组Day3笔记--strengthen

作者: strengthen_1552 | 来源:发表于2020-10-14 22:26 被阅读0次

linux环境下安装miniconda软件

minconda是什么,应用领域

miniconda是condoa的组成一部分,它是专门化的软件,主要是应用于生信领域的分析。

在Linux环境下的安装

直接输入命令

小洁老师给的命令
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

或者通过清华大学镜像网站https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/

前加wget 直接获取,该镜像网站的优点是下载速度非常快,因此备受关注,而通过直接官方网站下载的方式,下载速度比较慢。
下载完成后利用
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
进行软件的安装,在中间的过程中,需按照相关知识进行操作,当最终出现Thank you installing miniconda3说明该软件已安装成功。

激活conda

输入指令
source ~/.bashrc
是一步非常重要的步骤,激活完毕,即完成该软件的安装。

使用

  • conda list 查看当前服务器上安装的所有软件列表
  • conda search fastqc 搜索conda软件
  • conda install fastqc -y 安装软件fastqc

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