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使用mamba加快conda安装软件速度?

使用mamba加快conda安装软件速度?

作者: 生物信息与育种 | 来源:发表于2021-04-27 23:45 被阅读0次

conda是个安装软件的神器,但镜像不稳定,下载安装软件的速度有时很慢。对于几十Mb甚至上百Mb的软件往往下不动,下了半天可能失败。

找了一个叫mamba的加速神器,可以用来并行下载和安装,大大加快速度,减少失败几率。

首先,mamba本身需要先通过conda来安装:

conda install -c conda-forge mamba

依赖python,所以这里慢也没办法,只有等。

mamba安装成功后,后续所有软件安装都可将conda替换为mamba了,如mamba install -y bwa
如r下载:

mamba install -c conda-forge r-base

出现如下:


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