学习小组Day 3---linux环境下的软件安装 --ling

一. 关于conda/miniconda
conda相当于app store，最方便快捷的软件下载器，而日常生信使用Miniconda即可。
二. 下载Miniconda

1. google “miniconda 清华”，可以看到miniconda有x86_64/x86两种版本。再输入命令行 uname -a查看服务器是多少位的，然后安装脚本 wget 复制下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 到biosoft 目录

        ![安装脚本.png](https://img.haomeiwen.com/i23650630/a9be3e7807173c5f.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
   

2. 安装miniconda
   命令行 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_4.sh 安装过程中，碰到版权信息，按enter键，碰到yes/no，输入yes，返回，直到安装成功。

安装成功.png

接下来重要的一步就是激活conda，命令行 source ~/.bashrc
添加镜像 复制粘贴代码，再回车
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

激活安装.png
添加镜像.png

三.使用conda

1. conda list 查看安装的所有软件列表

   
   conda list.png

2. conda search fastqc 搜索conda软件，不过得等好久好久

3. conda install fastqc -y 安装软件

   
   安装　ｆａｓｔｑｃ　－ｙ.png

4. conda remove fastqc -y卸载软件

   
   remove fastqc -y.png