Open Babel编译安装

作者: 生信杂谈 | 来源:发表于2017-07-05 20:07 被阅读61次

Open Babel是一个非常优秀的支持多种分子格式的开源软件,同时可以进行2D 3D格式的转换,也可以编写脚本。编译安装方法如下:

官方教程:点我查看
先下载最新的版本:点我下载
解压缩:

tar zxf openbabel-2.3.2.tar.gz 

# (this creates openbabel-2.3.2)

mkdir build

cmake构建软件:

cd build

cmake ../openbabel-2.3.2

如果你需要特别的设置,则需要-D
来进行设置,-D CMAKE_INSTALL_PREFIX=~/Tools -D CMAKE_BUILD_TYPE=DEBUG 两个设置一个设置目录,一个设置类型,自我感觉没有必要使用

make /make -j {num}   
 
# {num}表示要使用多少核,例如 make -j4  表示四核make install

在cmake时可以参与更多设置:
设置GUI: -DBUILD_GUI=ON linux GUI是wxWidgets制作的,所以你的python必须安装了wxWidgets ,个人觉得linux你都回了就没有必要使用GUI了
语言编译: 例如python -D PYTHON_BINDINGS=ON
然后再设置python的环境变量:export PYTHONPATH=/usr/local/lib:$PYTHONPATH
其中PYTHON可以替换成你的语言类型:PYTHON, CSHARP, PERL, JAVA 或 RUBY,如果都想安装,可以将PYTHON 替换为ALL

更多原创精彩视频敬请关注生信杂谈:

相关文章

  • Open Babel编译安装

    Open Babel是一个非常优秀的支持多种分子格式的开源软件,同时可以进行2D 3D格式的转换,也可以编写脚本。...

  • 用 Babel 去构建 TypeScript 项目

    一、Babel 编译 TS 现在空项目中创建 package.json 文件,再去安装 Babel,@babel/...

  • Babel使用方法

    babel安装:全局安装 npm install babel-cli -g常用命令:--out-file 编译文...

  • babel

    现在不推荐将babel安装在全局 进入项目,创建package.json 使用babel编译 将babel指令写入...

  • Javascript编译器之Babel

    官网 babel中文官网地址[https://babel.docschina.org/] 安装 示例目录结构 编译...

  • webpack使用

    Babel & React 一、安装Babel Babel执行编译文件的过程中,会从项目根目录下的.babelrc...

  • 在Vue项目按需引入Vant组件

    1.安装Vant 2.安装babel 插件 按照官网上写的,安装babel 插件后,就能在编译过程中将 impor...

  • babel 入门使用 (babel 7.4.0)

    官网 安装 使用例子 根目录创建配置文件 babel.config.js 执行编译yarn babel src -...

  • 解决 SyntaxError: Cannot use impor

    原因: npm运行node项目, 需要babel编译, 才能支持import等高级语法; S1: 安装babel...

  • webpack(六) babel-loader

    babel-loader用来处理ES6语法,将其编译为浏览器可以执行的js语法 安装babel-loader 安装...

网友评论

    本文标题:Open Babel编译安装

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/pozqhxtx.html