正常的gtf文件不能直接被Hisat2使用，需要按hisat2的要求进行转换
1. 提取外显子
extract_exons.py inout.gtf > output.exon
2. 提取剪切位点
extract_splice_sites.py input.gtf > output.ss
3. 提取SNP（可选）
extract_snps.py input.snp > output.snp
extract_exons.py inout.gtf > output.exon
extract_splice_sites.py input.gtf > output.ss
extract_snps.py input.snp > output.snp
本文标题：hisat2: gtf文件的转换
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/ppqacktx.html
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