学习小组Day3笔记--镜筒

Conda是什么

• Linux的应用商店
• 最方便快捷的软件下载器
• 90%以上的软件都能搜到，一键安装
• 日常生信使用小而精的Miniconda即可

安装Conda（省略）

Conda操作

• conda list：查看当前服务器上安装的所有软件列表
• conda search 软件名：搜索conda软件
• conda install 软件名 -y ：安装软件（-y是指安装过程中的问题都回答yes）
• conda install 软件名=版本号 -y：安装特定版本软件
• conda remove 软件名 -y ：卸载软件
• conda update 软件名:conda update 软件名
• conda info --envs：查看当前conda有什么环境
• conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y：建立rna-seq环境，指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic
• conda activate rna-seq:激活conda环境
• conda deactivate:退出当前环境
• conda卸载：
  第一步——rm -rf ~/miniconda3
  第二步——环境变量中去掉conda, vi ~/bash_profile 删除conda路径，退出保存