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如何快速了解接触的质粒(四)

如何快速了解接触的质粒(四)

作者: 小乔爱科研 | 来源:发表于2021-10-23 13:53 被阅读0次

    会读质粒图才能用好质粒。

    前面部分稍微复杂一点的启动子和复制子已经大概介绍完了,后面会慢慢补充遗漏的小知识点,这一part是相对简单但是对于克隆筛选非常重要的----抗性基因。

           抗性基因是一段已知功能或已知序列的DNA片段,起到特异性标记的功能。使细菌对氨基苄青霉素,氯霉素等抗生素产生抗性,利用此来判断基因表达载体是否成功导入细胞内。

    pUC19 质粒图谱

    pcDNA 3.1(+)质粒图谱

    上面质粒图谱中圈出的AmpR,NeoR/KanR等表示质粒中抗性筛选标签,方便后面筛选出阳性克隆(重组成功的阳性质粒;自连的假阳性质粒需要后续质粒测序验证)。抗性基因可以参考用来区分质粒的种类,像复制起点一样,质粒中有两个复制起点一般为穿梭质粒;类似的质粒中有两种抗性基因一般为穿梭质粒(pcDNA3.1(+))。

    抗生素可以买粉末选择合适浓度和溶剂自己配制,也可以购买现成抗生素按照说明书上比例稀释直接使用即可。注意为了保证长期保存,常需要过0.22μm滤膜,避光;分装;-20°C冷冻保存。

    01

    原核抗性

    下面是常用于原核生物的抗生素

    02

    真核抗性

    新霉素(Neomycin)/G418

            新霉素是一种氨基糖苷类抗生素,能够结合到细菌核糖体 30S 和 50S 亚单位引起 蛋白错误编码,在蛋白合成期间抑制起始和延长,对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌均 有效,尤其是对金黄色葡萄球菌、白喉杆菌和炭疽杆菌作用更有效。与卡那霉素有完 全交叉抗药性,与链霉素有部分交叉抗药性。

            新霉素的使用浓度跟细胞培养方式、细胞种类、载体 DNA 有关。悬浮培养细胞更敏感,使用浓度低,贴壁细胞使用浓度高。硫酸新霉素工作浓度 范围为 100~1000 µg/ml。

        2. 嘌呤霉素(Puromycin Dihydrochloride )

            Puromycin是来源于Streptomyces alboniger的一种氨基核苷类抗生素,中文名为嘌呤霉素,常用于筛选通过质粒转染/转化、病毒感染等方法能表达pac基因(puror)的真核或原核多克隆或单克隆细胞。Puromycin不仅用于稳定细胞株的筛选,也用于稳定细胞株的维持。Puromycin的特点是快速作用于细胞,一般2天内可以杀死99%的不表达pac基因的细胞。

        3. 潮霉素B(Hygromycin B)

            Hygromycin B(潮霉素B)是来源于吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus)的一种氨基糖苷类抗生素,对细菌,真菌和哺乳动物细胞均有抑制作用和细胞毒性。

            Hygromycin B(潮霉素B)通过干扰蛋白翻译过程中70S和80S核糖体易位,诱导对mRNA模板的错误翻译而抑制细胞蛋白质的正常合成,从而导致细胞死亡。

            大肠杆菌来源的Hygromycin B抗性基因(hyg或hph)所编码的Hygromycin B磷酸转移酶可将Hygromycin B磷酸化,导致其失去活性,从而起到解毒作用。因此,Hygromycin B可用于筛选成功转染了Hygromycin B抗性基因的原核或真核细胞。

        4. 博莱霉素(Zeocin )

            Zeocin即phleomycin D1,中文名称博来霉素或者腐草霉素D1,是从轮状链霉菌(Streptomyces verticillus)的一个突变体菌株中分离而来的博来霉素/腐草霉素(bleomycin/phleomycin)的抗生素家族成员。它对细菌、真菌(包括酵母)、植物和哺乳动物细胞均有抑制作用和细胞毒性。

            Zeocin是一种碱性、水溶性的、铜离子螯合的糖肽抗生素。Cu2+螯合的Zeocin溶液呈现蓝色,无活性。当其进入细胞后,Zeocin上的Cu2+被还原为一价铜离子(Cu+),并被细胞内的巯基化合物(sulfhydryl compound)清除,导致Zeocin被活化,能够结合到细胞内DNA上并使其断裂,最终导致细胞死亡。

            上面是原核生物和真核细胞中常用到的筛选抗生素,可以根据实验需要寻找合适的抗生素,这一部分就先讲到这里。

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