单细胞SRR数据拆分

作者: Zee_李海海 | 来源:发表于2021-11-10 13:41 被阅读0次

单细胞SRR数据拆分
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10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq

fastq-dump SRA转fastq

#10x SRR需要加--split-file和--include-technical参数
fasterq-dump -O ./ --split-files -e 40 ./SRR7722937  --include-technical
ls -lh

参考链接：
10X单细胞转录组测序数据的 SRA转fastq踩坑那些事
 fasterq快速转换sra文件到fastq测序数据
 单细胞实战(二) cell ranger使用前注意事项

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