GBLUP 来自SNP-BLUP

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VanRaden's G

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所以GBLUP为（出现在大约2009年）：

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多性状的GBLUP

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可靠性

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GREML, G-Gibbs

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GBLUP 等于 SNP-BLUP

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其中的blending和tuning作用

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其中tuning

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其中的Metafounders方法是目前较好的一种方法

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tuning 平均值：

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tuning 方差：

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Tuning平均值和方差同时（Blupf90默认设置）：
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Blending

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应该先tuning，再blending

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确定新的Metafounder

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单一Metafounder

应该将A调整为适合G：

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Metafounder的关系

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但是什么是基因组genomic（加性）关系？

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系谱关系矩阵- A

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基因组矩阵-G

来自VanRaden(2007, Interbull)

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gene content的协方差（看为一个性状）

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p_i的使用

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G的一些特性

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注意两个个体之间的关系为负值时，是可能存在的（不能设为0）

负值这意味着个人 i 和 j 比数据中的平均个人对更远

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一个真实例子：

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IBS在marker之间的关系

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IBS和IBD

标记处的 IBS (𝐺_{𝐼𝐵𝑆𝑖𝑗}) 是真实IBD（R_ij） 的常用估计量

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我们应该使用哪种等位基因频率？

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