美文网首页
9月发表在线数据库汇总

9月发表在线数据库汇总

作者: drlee_fc74 | 来源:发表于2020-10-23 20:00 被阅读0次

九月份一共发表了近22个数据库。其中疾病相关的数据库疾病相关的数据有5个;蛋白相关的数据库有9个。在RNA方面,三个数据库都是和非编码有关的。

后台回复:2009可获得9月的数据库的pdf

以下是所有数据库的简单介绍。

疾病相关数据库

IDDB:不育症在线数据

IDDB(http://mdl.shsmu.edu.cn/IDDB/)提供与不孕症有关的基因、实验和临床记录的多功能的数据库。里面的数据可以免费提供给对生殖和不孕症感兴趣的生物学家和医生。

image

StoneMod:肾结石相关数据库

StoneMod(https://www.stonemod.org)收集了肾结石相关的蛋白,通过这个数据库可以了解那些蛋白和肾结石相关。

image

MosaicBase: 非肿瘤疾病相关数据库

MosaicBase(http://mosaicbase.com/)是一个非肿瘤相关的数据库,通过疾病,突变或者基因的检索来发现输入内容和疾病的特征。

image

PCOSKB: 多囊卵巢数据库

PCOSKB(http://www.pcoskb.bicnirrh.res.in/)是一个检索和多囊卵巢有关基因的数据库。

image

CaNDis: 疾病药物检索数据库

CaNDis(http://candis.ijs.si/#)是一个检索疾病相关药物数据库。

image

DNA相关数据库

muTarget: 突变对于基因表达的影响

muTarget(http://www.mutarget.com)是一个对分析突变对于基因表达影响的数据库。

image

hTFtarget: 转录因子调控预测数据库

hTFtarget(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget)是一个综合性的预测转录因子靶标的数据库。

image

RNA相关数据库

ncRDeep: 非编码RNA分类数据库

ncRDeep(http://home.jbnu.ac.kr/NSCL/ncRDeep.htm)是一个基于神经网络来预测non-coding RNA的数据库。

image

LncAS2Cancer: lncRNA可变剪切相关数据库

LncAS2Cancer(https://lncrna2as.cd120.com/)是一个预测在肿瘤发生过程中和肿瘤有关的数据库。

image

MNDR v3.0: ncRNA与疾病相关数据库

MNDR v3.0(http://www.rna-society.org/mndr/)是一个储存疾病相关ncRNA的数据库。MNDR v3.1当前包含超过一百万个ncRNA疾病条目,包括6,301多种miRNA,39,880多种lncRNA,20,256 circRNA,10,894 piRNA和521个snoRNA,它们具有1,600多种疾病,并且物种覆盖率增加到11种哺乳动物。

image

蛋白相互数据库

dbCAN-PUL: 碳水化合物活性酶数据库

dbCAN-PUL(http://bcb.unl.edu/dbCAN_PUL/)一个经过实验验证的碳水化合物活性酶及其底物数据库。

image

MPTherm-Pred: 跨膜蛋白突变预测数据库

MPTherm-Pred(https://web.iitm.ac.in/bioinfo2/mpthermpred/)是一个预测跨膜蛋白突变对于热稳定性的分析和预测数据库。

image

iDRBP_MMC: DNA结合蛋白以及RNA结合蛋白识别数据库

iDRBP_MMC(http://bliulab.net/iDRBP_MMC)是一个基于神经网络识别DNA结合蛋白以及RNA结合蛋白的数据库。

image

iDPPIV-SCM: 二肽基肽酶IV抑制肽数据库

iDPPIV-SCM(http://camt.pythonanywhere.com/iDPPIV-SCM)是一个基于序列预测二肽基肽酶IV抑制肽数据库

image

TBDB: T-box核糖体折叠注释数据库

TBDB(https://tbdb.io)是一个注释T-box核糖体的数据库。

image

DynaMut2: 错义突变对于蛋白稳定性和灵活性的影响

DynaMut2(http://biosig.unimelb.edu.au/dynamut2)是一个预测错义突变对于蛋白稳定性和灵活性的影响。

image

SAAMBE-SEQ:蛋白质复合物中的单个突变后的结合能变化预测数据库

SAAMBE-SEQ(http://compbio.clemson.edu/saambe_webserver/indexSEQ.php#started)是一个通过序列预测蛋白复合物当中单次突变对于结合能变化影响的数据库。

image

HybridSucc: 琥珀酰化位点预测数据库

HybridSucc(http://hybridsucc.biocuckoo.org/)是一个基于序列来预测琥珀酰化位点预测数据库。

image

CancerEnD: 肿瘤相关增强子数据库

CancerEnD(https://webs.iiitd.edu.in/raghava/cancerend/)是一个基于整合了多个数据库,来寻找和肿瘤相关增强子的特征的数据库。

image

流程化在线工具

PAWER:蛋白芯片分析网站

PAWER(https://biit.cs.ut.ee/pawer)是一个在线分析蛋白芯片的网站。通过分析可以获得差异蛋白的结果以及简单的富集分析的结果。

image

其他数据库

SMI-BLAST: 蛋白BLAST数据库

SMI-BLAST(http://bliulab.net/SMI-BLAST/)是一个蛋白blast的数据库。同时可以了解其蛋白的三级结构。

image

METAGENOTE: 基因组注释数据库

METAGENOTE(https://metagenote.niaid.nih.gov)是一个基因组注释和比对的数据库。

image

相关文章

  • 五月份医学科研在线数据库发表汇总(截止05.21)

    由于每个月都会有相关的数据库文章发表,所以我们打算在每个月都会先出一个汇总贴来介绍一下这个月都发表了哪些在线的数据...

  • 9月发表在线数据库汇总

    九月份一共发表了近22个数据库。其中疾病相关的数据库疾病相关的数据有5个;蛋白相关的数据库有9个。在RNA方面,三...

  • 视频网站合集

    会员制影视剧网站 免费在线影视网址汇总 在线欧美剧网站汇总 在线动漫网站汇总 在线国语版视频站 在线日韩网站汇总 ...

  • 2021.02在线数据库汇总

    在2月期间,总共发表了医学相关在线数据库29个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据库...

  • 2020.12在线数据库汇总

    在12月期间,总共发表了医学相关在线数据库47个。下面就来给大家介绍一下主要有哪些数据库,以及笔者比较感兴趣的数据...

  • 11月在线数据库汇总

    在11月期间,总共发表了医学相关在线数据库70个。其中一些经典数据库的更新的相关文献也在这个月进行了发表。其中就包...

  • JAMA surgery 喊你来提高基于大规模数据库研究的水平

    2018年6月 JAMA surgery在线发表了 Editorial文章专门点评基于大型临床数据库的研究。 一个...

  • 10月数据库汇总

    截止9.21-10.21之间总共 发表了在线医学相关数据库49个。由于微生物和病毒方面的数据库比较多。所以相较于之...

  • 免费 - 超实用的在线分子生物学相关工具网站汇总!

    科研猫今天 Addgene网站发表了一篇博客,汇总罗列了多个免费在线分子生物学相关工具网站,涵盖引物设计、质粒图谱...

  • TDSQL-数据库管理

    数据库管理用户管理 在线DDL 在线SQL 在线SQL日志 数据库参数 防火墙 ...

网友评论

      本文标题:9月发表在线数据库汇总

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rfkbmktx.html