wtdbg2软件下载与安装
git clone https://github.com/ruanjue/wtdbg2
cd wtdbg2
make
进行基因组装
第一步是组装
第二步是得到一致性序列
#! /bin/sh
～/usr/wtdbg2-master/wtdbg2 -t 16 -x sq -g 370m -i ../data/pb.fasta.gz -fo prefix
～/usr/wtdbg2-master/wtpoa-cns -t 16 -i prefix.ctg.lay.gz -fo prefix.ctg.fa
-t 核数 16, -x 测序平台 PacBio Sequel, -g 基因组预估大小 370 Mb
参考：
https://github.com/ruanjue/wtdbg2
http://www.chenlianfu.com/?p=2647
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本文标题：wtdbg2 三代基因组组装
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/rizyaktx.html
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