文献标题： Bystander CD8+ T cells are abundant and phenotypically distinct in human tumour infiltrates

来源：18年 nature

中文名：旁观者 CD8 + T 细胞在人类肿瘤浸润物中丰富且表型不同

文献截图

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思路：

收集病人的数据，然后测bulk RNA，WES，质谱，得到TCR信息，预测可以与新抗原结合的TCR，然后根据使用MHC-antigen与TCR（四聚体assay）结合情况，将TCR对应的CD8TIL分为tumor unrelevant和Tumor reactive。

备注：作者将抗原分为新抗原，肿瘤相关抗原，肿瘤无关抗原（例如EBV LCMV）。

主要特点：

他们没有找到肿瘤相关抗原特异性的CD8TIL，但是存在大量肿瘤无关的TIL（即不对新抗原反应的TCR），tumor-reactive T（与新抗原结合的CD8TIL）占比很少。
Tumor reactive T cell特征是CD39+高表达，clone size高。
问题：
Tumor reactive T cell只用了4个样本，且其中2个不是常见的肺癌，是很罕见的淋巴细胞样肺癌。存在局限性。

信息：

CCR7 naïve cell；
memory：
CD45RO CD69 CD1103 CD49a
激活性marker：
CD27 CD28 CD127 ICOS OX40
抑制性marker：
TIGIT 2B4 CD57 PD1 CD39
CD39+CD8 TIL tumor-reactive T cell
CD39-CD8 TIL bystander T cell

个人想法

文章的方法很直接，证据比较有力，即用与neoangigen结合的TCR作为tumor-reactive的标准，而不是用inhibitory receptor表达以及TCR clone size；唯一的缺陷是使用的tumor reactive T cell的样本太少，只有4个，其中2个还是不常见的淋系表皮细胞样癌（一种罕见的肺癌）。

希望自己有时间，持续更新单细胞测序文章。另外，不知道是手动全文翻译，还是想这样写文献阅读笔记有助于读者阅读，后面可能会全文翻译一些综述