distmat 可用于计算遗传距离，得到距离矩阵
可通过在线进行遗传距离的计算，网址：http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/emboss/distmat
输入的文件为比对文件，可以在上述网站看示例即可。
在线
选择模型后，进行运算
而后得到如下的距离矩阵
距离矩阵
可以看到，相同样本间距离为0，数字越大，表示距离越远
安装
conda install -c bioconda emboss=6.6.0
还是以上述的示例文件为例,进行运行
distmat -sequence alignment -protmethod 1 -outfile test
## 参数
-sequence： 比对文件
-protmethod： 蛋白替换矫正方法 0: Uncorrected， 1: Jukes-Cantor，2:Kimura Protein
-nucmethod：核酸替换矫正方法 0: Uncorrected， 1: Jukes-Cantor，2:Kimura Protein
结果也是如同上述一样
distmat 可用于计算遗传距离，得到距离矩阵 1 在线运算 可通过在线进行遗传距离的计算，网址：http://...
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本文标题：distmat 计算遗传距离
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