2022-03-17 安装samtools

作者: 学习生信的小兔子 | 来源:发表于2022-03-17 22:06 被阅读0次

2022-03-17 安装samtools
基因组分析
已解决：samtools和sambamba报错
RBP AS生信流程（附）软件安装
Samtools版本更新
Samtools安装
linux习题11-20题
【samtools】运行报错: error while load
augustus安装
[samtools] bam 文件合并提示No @HD tag

https://github.com/samtools/samtools/releases/
wget -c https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.15/samtools-1.15.tar.bz2
tar jxvf samtools-1.15.tar.bz2
./configure --prefix=/home/data/vip12t42/software/samtools-1.15
make
make install
./samtools --help
echo 'export PATH="/home/data/vip12t42/software/samtools-1.15/bin:$PATH" ' >>~/.bashrc
source ~/.bashrc

参考：https://www.jianshu.com/p/6b7a442d293f

2022-03-17 安装samtools
参考：https://www.jianshu.com/p/6b7a442d293f[https://www.jia...
基因组分析
bwa 安装使用 Samtools 安装使用 Picard 安装使用
已解决：samtools和sambamba报错
samtools报错现在samtools的版本已经在1.9以上了，但是conda安装的samtools版本依然是1...
RBP AS生信流程（附）软件安装
samtools 尝试了各种方法后，最后用conda install samtools安装成功 Piranha 安...
Samtools版本更新
卸载旧版本samtools 安装版本samtools 参考：如何卸载Ubuntu软件fatal error: zl...
Samtools安装
下载网址：http://www.htslib.org/download/[http://www.htslib.o...
linux习题11-20题
十一、安装 samtools 软件 miniconda安装 wget -c https://mirrors.tun...
【samtools】运行报错: error while load
samtools用conda安装后，总是出现共享库缺失的报错。即便你刚安装samtools时可以用，但后面在同一环...
augustus安装
安装之前，需要安装的软件：boost，samtools，bcftools，bamtools，docker，htsl...
[samtools] bam 文件合并提示No @HD tag
使用版本 samtools 1.9 我找的别人安装好的旧版本，替换的samtools 0.1.13 版本，可...