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4+单基因纯生信,投稿到接收44天!基因选的好,研究过很多也没关

4+单基因纯生信,投稿到接收44天!基因选的好,研究过很多也没关

作者: 生信小课堂 | 来源:发表于2023-03-09 09:42 被阅读0次

    今天给大家介绍一篇单基因纯生信的SCI文章,文章发表于frontiers in oncology,今年的影响因子应该会在6分以上。对于单基因的分析,挑选基因最为关键。小编认为容易发表的基因要符合以下几点(符合条件越多越好):

    1 在多种肿瘤中该基因高表达

    2 在多种肿瘤中该基因高表达的患者预后差

    3 在多种肿瘤中该基因在高分期表达较高

    4 不同肿瘤中的富集分析有比较集中的几种结果

    5 在一种或者多种肿瘤中与特定免疫细胞浸润相关,如巨噬细胞,CD8T细胞等

    6 最好用不同的方法证明5中的结论

    7 在某一种或者几种肿瘤中集中于一些免疫相关基因相关性高

    8 该基因最好报道过,但是又研究较少,有一定新颖性

    如果能筛选到这样的基因,再添加单基因的各种层面分析,肯定是比较容易接收的。能再加一些实验验证就更好不过了。另外,我们也推出了最新的单基因泛癌高阶套路。详见往期发文。

    需要了解的话欢迎交流。

    文章名:Comprehensive Pan-Cancer Analysis Confirmed That ATG5 Promoted the Maintenance of Tumor Metabolism and the Occurrence of Tumor Immune Escape

    影响因子:4.848,即时影响因子:6.04.

    ATG5这个基因我检索了一下,在肿瘤中的研究有1361篇,着实的非常多了,然而只要是结果好,依然可以发表!这让我对手里的一些基因有了信心。

    像我们ID004和ID005的研究是比较少的,而ID001的研究比较多,少有少的好处,多有多的好处,只要结果好,不怕发不了!

    进入正文部分:

    Figure 1: 基因在TCGA GTEX CCLE中的表达情况

    Figure 2: 基因在泛癌中的单因素回归分析结果

    Figure 3: 基因在泛癌中的生存分析结果

    Figure 4: 基因与免疫细胞技能润,免疫评分基质评分的相关性

    Figure 5: 基因与免疫检查点和肿瘤抗原的相关性分析

    Figure 6: 基因与****肿瘤突变负荷和微卫星不稳定的相关性

    Figure 7: 基因****与DNA损伤修复和甲基转移酶相关的基因的相关性分析

    Figure 8: 最后就是基因的GSEA富集分析

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