关注椰菜耶这个小小公众号的朋友都知道，椰菜君端上来的主要是乌鸦汤，鸡汤屈指可数。这不是椰菜君不爱鸡汤——鸡汤人人爱喝，椰菜君也迫切希望码的文字有更多的人阅读，但自闭症的科学研究现况就是乌鸦汤远远多过鸡汤。乌鸡变不了金凤凰，乌鸦也变不了三黄鸡，但是乌鸦汤至少可以让我们更接近现实世界，毕竟谁也不能靠幻象活着。
接续昨天的《DEAF1基因和自闭症》一文。
根据这位家长提供的信息，在做了外显子测序后，得到的结果是孩子的DEAF1存在一个突变Arg530Cys。这个突变的意思是，在DEAF1基因所对应的那个转录因子蛋白质里面，第530个氨基酸从原本的Arg精氨酸突变成了Cys半胱氨酸。
那么知道这个突变位点信息有什么作用呢？
DEAF1基因所对应的那个转录因子，一边要结合在它要控制的基因上面，一边也要同其它蛋白质结合——接受转录信号。这就像一个官儿要做事，肯定不能单靠自个，需要有下属，更需要有上司；如果和下属上司沟通不良，就是自己再能干，这官儿也是做不好的。
因此，这个转录因子——其它转录因子也一样，浑身上下是可以分成好几个部分，各个部分都有自己的功能。显然，不同部位出现突变，对整体功能的影响是不一样的。就像官儿和下属可以沟通不良，和上司这样胡来就不得了了。
就DEAF1基因所对应的那个转录因子来说，有这么几个功能部分：
SAND域和锌指序列ZnF域，主要负责识别和结合要控制的基因；
核定位信号NLS域和核输出信号NES域，负责控制进入和离开细胞核（因为基因都在细胞核里面）；
MYND域，和其它蛋白质结合。
根据2019年的一项研究，后果严重的DEAF1基因突变主要出现在SAND域（下图红色框部分），导致这个转录因子失去和基因结合的能力。当然，少数出现在这个部位的突变，比如第224位的精氨酸Arg突变为Gln谷胱酰胺，对此能力没有什么影响，可能和突变前后氨基酸性质比较接近有关（作为对比，如果它突变成差别很大的Trp色氨酸，就不行了）。
前文提到的阿曼家庭，所出现的突变位置约在图中的紫色标记处，并且这个突变不是氨基酸种类改变，而是整个蛋白质到此为止没有了；所以导致问题特别严重。
前文提到的那位有基因突变，不能走路不能主动语言，但是可以打字交流并完成初一考试的患者，所携带的两个突变如图中黄色、粉色框所示，是4个远离基因结合部位的突变中的两个。这两个突变基本不影响这个转录因子同基因的结合能力，并且处于蛋白质的后半部分，可能是他是所有患者中唯一一个认识能力没有问题的特殊原因。（另外两个突变，Arg44和Phe527，来自另一位患者，其中Arg44这个突变导致整个基因从开头部分就出现错误，因此这位患者情况就严重。）
回到开头部分，这位家长的孩子的DEAF1只有一个突变Arg530Cys，正好位于MYND域（图中绿色标记），可以猜测，孩子的情况可能比前述那位特殊患者会更好，认知能力可能没有问题，运动功能也可能接近正常，主动语言可能会欠缺但可能不至于完全无语。
同家长交流后，上述猜测基本得到证实。
因此，知道这个突变位点信息，还是有那么点儿作用。
主要参考文献
De novo and biallelic DEAF1 variants cause a phenotypic spectrum.Genet Med. 2019 Sep;21(9):2059-2069.
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