1.下载拟南芥基因组与注释文件
2.打开TBtools(Gff3extract)
得出结果
1.下载拟南芥基因组与注释文件 2.打开TBtools(Gff3extract) 得出结果
输入数据下载蛋白数据,提取最长转录本(可利用TBtools中的Fasta Get Representive) Or...
一:准备文件 1.拟南芥转录本id2.拟南芥gtf文件(不是gff)3.绘图工具:Gene Structure D...
导读 本文将介绍为什么要提取最长转录本,以及如何从 fasta和gff3文件中提取最长转录本。 1. Why 由于...
在上一篇中,本来说好的是“如何提取拟南芥(或非模式物种)基因的启动子序列_基于R”,结果却只说了提取拟南芥的情况。...
此版本为无代码版本,依赖tbtools来实现,纯粹记录自己的学习经验。 蛋白序列的blast比对 选择拟南芥基因家...
提取最长转录本是一个常见的功能,本脚本会生产两个文件maxpep文件为仅含有最长转录本的fasta文件,maxpe...
使用TBtools做物种间共线性分析的时候,使用A物种基因和拟南芥的基因做共线性分析,得到的collinearit...
首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 ...
写在前面 前天,我写了一个 TBtools 插件,意在让所有人都能自主分析转录组测序数据,进而获得 基因表达量矩阵...
本文标题:TBtools提取拟南芥所有转录本
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/bfjeortx.html
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