CRISPR/Cas9的方便高效不断带给人们惊喜。以往基于CRISPR/Cas9的基因编辑多以单个位点的操作为目标，力求减少对基因组其他位置的影响（即所谓的Off-target，脱靶效应）。不过有研究者突发奇想，如果将染色质碎片化，于细胞而言又会如何呢？今天分享的这项研究就是利用CRISPR/Cas9靶向不同染色体的多个位点，造成染色碎片化，进而观察细胞的存活以及基因组与转录组的变化。
染色体洗牌
三言两语
- 人类基因组中存在大量的重复序列，例如LINE1的基因座位超过50万，而Alu则超过100万。利用这种特点，研究者分别设计了靶向7398个LINE1基因座位的sgL1和靶向319724个Alu基因座位的sgAlu。通过Sleepy beauty转座系统将携带sgRNA和Cas9的表达系统整合进细胞中，经过抗生素筛选，三周后获得存活的细胞。（PS.这存活的细胞太强了，这么多把“魔剪”围剿都能幸存！！！）
2.针对存活细胞的细胞生存分析发现，其与对照组在增殖能力上基本上没有差别，而针对全基因组，转录组以及表观组的测序分析则发现，靶向LINE1和Alu的细胞经历了一次染色体大洗牌，其核型与对照组存在显著差异。
Ref
Liu, Y. et al. Systematic Chromosome Rearrangement Induced by CRISPR-Cas9 Reshapes the Genome and Transcriptome of Human Cells. bioRxiv, 2021.2006.2015.448470 (2021).
网友评论